Os primeiros medicamentos que surgiram tinham como base os conhecimentos etnobotânicos das populações, ou seja, as populações conheciam as plantas locais e as suas aplicações para o tratamento e prevenção das patologias. Com o presente trabalho procura-se descrever os princípios ativos presentes nas plantas e descrever a aplicação medicinal de plantas endémicas portuguesas. No desenvolvimento do trabalho verificou-se que em Portugal existe uma base de dados online onde é possível consultar todas as plantas endémicas e a região onde se encontram, porém as suas aplicações não se encontram descritas. O estudo das plantas medicinais no nosso país baseia-se, essencialmente, nos estudos etnobotânicos desenvolvidos pelos investigadores nas diferentes regiões. No entanto, os estudos fitoquímicos e farmacoterapêuticos desenvolvidos em plantas endémicas são, ainda, escassos. Pela análise dos estudos etnobotânicos analisados verificou-se que a grande parte das plantas apresentam propriedades que têm efeitos no tratamento de doenças do sistema gastrointestinal, seguidas das que atuam ao nível da pele e por fim com efeito no sistema renal e hepático. Pela análise dos estudos fitoquímicos analisados verificou-se que a grande maioria das plantas descritas apresentam compostos com propriedades antioxidantes, antibacterianas e antifúngicas. Algumas plantas também já começam a ser aplicadas no tratamento e prevenção de patologias neurodegenerativas.