O microbioma oral é uma comunidade diversificada e complexa de microrganismos que reside na cavidade bucal e tem um papel fundamental na manutenção da saúde oral e sistémica. Uma saúde bucal adequada está ligada a uma maior diversidade microbiana, que consegue adaptar-se melhor às mudanças ambientais. Em crianças, o microbioma oral é dinâmico e crucial para a saúde geral e bucal. Entender os fatores que afetam o desenvolvimento e a composição desse microbioma é vital para garantir uma saúde prolongada. Objetivo: Conduzir uma revisão sistemática dos dados provenientes de estudos disponíveis sobre os fatores que influenciam o microbioma oral em crianças. Metodologia: Foi realizada uma pesquisa bibliográfica nas bases de dados PubMed, SciELO e Cochrane utilizando as seguintes palavras-chave: microbioma oral, crianças, disbiose, alimentação, aleitamento materno e artificial, genética e higiene oral. Os critérios de inclusão abrangeram publicações em inglês, lançadas entre 2017 e 2024, com texto completo acessível. Os artigos identificados foram inicialmente triados por meio da leitura dos resumos. Posteriormente, os artigos considerados pertinentes foram selecionados para uma análise completa. Resultados: Foram selecionados 10 estudos que avaliaram o impacto de fatores microbioma oral em crianças. Conclusão: Com base nos estudos aqui abordados, pode-se concluir que o microbioma oral de uma criança é influenciado por diversos fatores que podem ocorrer desde a fase pré-natal. Os fatores de influência mais importantes são idade, tipo de nascimento, tipo de alimentação (leite materno ou fórmula), saúde bucal da mãe e doenças como diabetes gestacional ou diabetes tipo 1.