En los últimos años, ha aumentado la importancia de las emociones en la educación escolar. La bibliografía actual ha puesto de manifiesto los beneficios de generar climas de aula positivos, en los que existan relaciones afectivas entre los agentes involucrados en el proceso educativo. El presente estudio tuvo por objetivo conocer la relación entre el clima de aula generado y las emociones experimentadas por los estudiantes. La hipótesis planteada fue que el clima de aula generado podría predecir las emociones experimentadas por los estudiantes. Para ello, se utilizó una muestra de 417 alumnos y alumnas de educación secundaria (44.1% hombres y 55.9% mujeres) pertenecientes a tres centros educativos de Huelva (Andalucía, España). A estos estudiantes se les preguntó sobre el clima existente en el aula y las emociones experimentadas durante sus clases de educación física. Los resultados del estudio confirman la relación entre el clima de aula y las emociones, destacando el poder predictor de las dimensiones “satisfacción e involucración en el aula” y “relación con el profesor” para predecir las emociones experimentadas por los estudiantes. Dichos resultados permiten poner en valor la importancia de generar climas positivos a través de la creación de vínculos emocionales entre profesores y alumnos. De esta forma, los alumnos y las alumnas se sentirán a gusto y generarán emociones positivas tan importantes en el proceso educativo.