La provincia de Huelva es la de mayor superficie arbolada de Andalucía, aunque la mayoría de estos bosques proceden de plantaciones forestales, algunas muy antiguas. No obstante, aún conserva grandes extensiones de vegetación natural derivada de los enormes bosques mediterráneos de encina y alcornoque que poblaban la Península Ibérica. Se pueden identificar distintos tipos de encinares y alcornocales dependiendo de la litología y el bioclima. Muchos de ellos se encuentran profundamente transformados, ya que han perdido el estrato arbustivo al convertirlos en dehesas. Aunque no muy abundantes, también es posible identificar algunos bosques de melojo en el norte de la provincia y salpicando algunas zonas localizamos quejigos. Las distintas etapas de degradación de estos bosques conducen a matorrales, tanto seriales como nobles, que se extienden por numerosas zonas degradadas de la provincia. Se trata de jarales-aulagares, jarales-brezales, madroñales, lentiscares, etc. En los barrancos y afloramientos rocosos se da una vegetación muy particular, denominada casmofítica, que es rica en endemismos. En los entornos riparios, cuando el cauce es permanente, es posible detectar algunas de las formaciones típicas del bosque de ribera, entre las que destacan las saucedas, alisedas y fresnedas. Cuando el cauce es estacional o intermitente, aparecen formaciones típicas de cauces mediterráneos con fuerte estiaje como adelfares, zarzales, tarajales y tamujares. Con respecto a las plantaciones forestales, son muy frecuentes las de pinares y eucaliptares. En muchos casos, estos pinares, se han naturalizado. Finalmente, en el corazón de la sierra, existen abundantes castañares, introducidos desde hace siglos para la explotación de su fruto y la madera.