Se ha determinado el índice de cristalinidad (IC) mediante difracción de rayos X de muestras actuales y fósiles pertenecientes a esmalte, dentina y hueso de metápodo de équidos, jiráfidos, rinocerótidos y proboscídeos de diferentes yacimientos neógenos españoles. Con estos valores de la cristalinidad del apatito se estima semicuantitativamente la evolución de los cambios diagenéticos ocurridos en el material óseo fósil. Se ha observado que el esmalte presenta un IC mayor que la dentina y hueso de metápodo, debido a su estructura más compacta. Sin embargo, no hay una correlación clara entre el incremento de la cristalinidad y la edad de las muestras. Además, el contenido de flúor aumenta durante los procesos de fosilización y como consecuencia aumenta el IC en las muestras fósiles. Por otro lado, el enriquecimiento diagenético de carbonato no está relacionado con la edad de los yacimientos, pero al aumentar su contenido en el esmalte, dentina y hueso de metápodo, disminuye en ellos su IC. Los sedimentos adyacentes juegan un papel clave en los cambios de cristalinidad de los huesos fósiles, como es el caso de los yacimientos con arenas, donde las muestras tienen un IC alto, por el contrario los yacimientos de margas y arcillas tienen un IC más bajo.