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Proteínas PRPF40 como potenciales marcadores moleculares del cáncer de páncreas.

Authors: Jiménez-Lozano, Sandra; Duarte Ruiz, María; Kennel, Marion; Martínez Martínez, Noelia; Moreno Castillo, Adela; Hernández-Munaín, Cristina; Suñe, Carlos;

Proteínas PRPF40 como potenciales marcadores moleculares del cáncer de páncreas.

Abstract

Introducción/Objetivos: PRPF40A y PRPF40B son los ortólogos mamíferos del factor esencial de splicing Prp40 de levadura, los cuales muestran complejas interacciones con las maquinarias de transcripción y de splicing. Ambos han sido implicados en enfermedades neurodegenerativas y cáncer (1). Concretamente, PRPF40A se encuentra entre los genes con un mayor nivel de expresión en el análisis genómico de cambios de splicing alternativo basado en tejidos de adenocarcinoma ductal de páncreas (2), y recientemente se ha sugerido que PRPF40A puede servir como un biomarcador de diagnóstico y pronóstico para el cáncer de páncreas (CP) (3). Asimismo, un alto nivel de expresión de PRPF40A es desfavorable para la supervivencia. Por el contrario, los pacientes con alta expresión de PRPF40B muestran mejores tasas de supervivencia a los 5 años, lo que sugiere roles opuestos para PRPF40A y PRPF40B en la tumorigenicidad del CP (4,5). Los mecanismos moleculares por los que PRPF40A y PRPF40B participan en el CP son aún desconocidos. Metodología: Para conocer el papel de PRPF40A en el CP, se ha llevado a cabo un silenciamiento génico de PRPF40A empleando siRNA específicos y se ha estudiado la proliferación celular (resazurina, formación de colonias y ciclo celular), la apoptosis (anexina V-FITC/yoduro de propidio, medición de la actividad de las caspasas 3/7), la migración (ensayos de wound-healing) así como un estudio de RNA-seq para conocer los genes diferencialmente expresados a nivel transcripcional y de splicing.. Resultados y discusión: Nuestros datos preliminares se resumen en los siguientes hallazgos clave: i) la expresión de ARNm de PRPF40A es considerablemente mayor que la de PRPF40B en líneas celulares de CP; ii) la inhibición de PRPF40A reduce significativamente la viabilidad celular y la formación de colonias; iii) la eliminación de PRPF40A induce una parada del ciclo celular en G2/M y una apoptosis en células de CP; y iv) el silenciamiento de PRPF40A produce una importante desregulación en la transcripción y el splicing alternativo en líneas celulares de CP. Conclusiones: Nuestros resultados sugieren un papel esencial de PRPF40A en el control del crecimiento celular a través del control transcripcional y del splicing alternativo de numerosos genes celulares. Estos resultados, junto con otros, se discutirán para explorar los mecanismos moleculares por los cuales la desregulación de la transcripción y/o el splicing alternativo conduce a disfunciones humanas como el CP. Referencias: 1. Becerra S, Andrés¿León E, Prieto¿Sánchez S, Hernández¿Munain C, Suñé C. Prp40 and early events in splice site definition. WIREs RNA. 2016;7(1):17-32. 2. Wang J, Dumartin L, Mafficini A, Ulug P, Sangaralingam A, Alamiry NA, et al. Splice variants as novel targets in pancreatic ductal adenocarcinoma. Sci Rep. 2017;7:2980. 3. Huo Z, Zhai S, Weng Y, Qian H, Tang X, Shi Y, et al. PRPF40A as a potential diagnostic and prognostic marker is upregulated in pancreatic cancer tissues and cell lines: an integrated bioinformatics data analysis. OncoTargets Ther. 2019;12:5037-51. 4. cBioPortal for Cancer Genomics [Internet]. [citado 31 de octubre de 2024]. Disponible en: https://www.cbioportal.org/ 5. The Human Protein Atlas [Internet]. [citado 31 de octubre de 2024]. Disponible en: https://www.proteinatlas.org/

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