Objetivo. Analizar las diferencias en la composición de la microbiota intestinal y de biomarcadores fecales en pacientes pediátricos ingresados por COVID-19 en comparación con controles sanos. Material y métodos. Estudio multicéntrico, descriptivo, observacional y prospectivo. Se incluyeron pacientes de edades comprendidas entre 1 y 24 meses que precisaron ingreso hospitalario por COVID19 (diagnosticados por qPCR) en el periodo de tiempo comprendido entre la segunda y quinta olas de la pandemia. Se recogieron variables clínicas en la plataforma REDCap y se tomaron muestras de heces al ingreso y al mes tras el alta hospitalaria. Las muestras fueron congeladas a -20°C y enviadas en frío en triple embalaje según norma UN3373 al laboratorio centralizado de análisis (IPLA-CSIC). Estudio de la microbiota intestinal por metagenómica filogenética y marcadores inmunitarios/inflamatorios (calprotectina, citoquinas, ácidos grasos de cadena corta y derivados indólicos del triptófano) en aguas fecales por técnicas de inmunoensayo-Luminex. Se seleccionaron los pacientes incluídos en dos grupos etarios: recién nacidos (hasta 6 meses de vida) y lactantes (entre 6 y 24 meses). Se seleccionaron controles sanos, pareados en edad, no infectados ni vacunados contra el SARS-CoV-2. Análisis estadístico: software libre “R”. Resultados. Se reclutaron 19 casos (13 mujeres) en 6 hospitales de nuestro país y 17 controles. Ningún paciente precisó ingreso en UCIP. Dos pacientes cumplieron criterios de síndrome inflamatorio multisistémico (SIM). El motivo de ingreso principal fue la fiebre. Se observó sintomatología digestiva en el 72% de los casos, siendo la diarrea el principal problema gastrointestinal. Se observaron diferencias significativas en la composición de la microbiota intestinal, con mayores abundancias relativas de los filos Bacteroidetes, Proteobacteria y Verrucomicrobia en aquellos con COVID-19, y mayor presencia de Actinobacterias en los lactantes sanos. A nivel de género las diferencias fueron significativas (p= 0,004, U-Mann Whitney para muestras independientes) en la presencia de bifidobacterias, con unas abundancias relativas de Bifidobacterium en heces significativamente menores (11%) en pacientes que sus respectivos controles (44%). A nivel de especie, la abundancia de Bifidobacterium breve fue mayor en controles (12%) que en los casos (2%). Aunque se observaron disimilitudes en parámetros inflamatorios en aguas fecales, la baja concentración de muchas de las citoquinas excretadas dificultó su cuantificación fiable al encontrase fuera del rango dinámico. Conclusiones. La COVID-19 se asocia a cambios muy importantes en la microbiota intestinal de los lactantes. Se demuestra una menor presencia de bifidobacterias, grupo microbiano mayoritario y fundamental en el desarrollo del sistema inmune en esta primera etapa de la vida. Es necesario corroborar con el análisis de muestras tomadas en los meses posteriores al ingreso si esta disbiosis es consecuencia de la infección a nivel intestinal por SARS-CoV-2 o inherentes a la microbiota autóctona de los mismos.

Resumen del trabajo presentado en el XXVIII Congreso de la SEGHNP (Sociedad Española de Gastroenterología, Hepatología y Nutrición Pediátrica), celebrado en Palma de Mallorca (España), del 16 al 18 de junio de 2022