La peste porcine africaine (PPA) est une maladie virale dévastatrice en ré-expansion qui menace actuellement l'industrie porcine dans le monde entier. Les microARN sont une classe de 17 à 25 ARN nucléotidiques non codants dont il a été démontré qu'ils ont des fonctions critiques dans une grande variété de processus biologiques, tels que la différenciation cellulaire, la régulation du cycle cellulaire, la carcinogenèse, l'apoptose, la régulation de l'immunité ainsi que dans les infections virales par clivage ou répression translationnelle des ARNm. Néanmoins, il n'existe aucune information sur l'expression des miARN dans une infection à ASFV. Dans cette étude de preuve de concept, nous avons analysé les miARN exprimés dans la rate et les ganglions lymphatiques sous-mandibulaires de porcs infectés expérimentalement avec une souche virulente (E75) ou sa souche atténuée dérivée (E75CV1) d'ASFV, ainsi que, à différents moments après l'infection par la souche virulente, par séquençage à haut débit de petites bibliothèques d'ARN. La rate présentait un modèle d'expression plus différentiel que les ganglions lymphatiques dans une infection à ASFV. Parmi les miARN les plus abondants, 12 ont été exprimés différemment dans les deux tissus à deux moments différents chez les animaux infectés par la souche virulente. Parmi ceux-ci, miR-451, miR-145-5p, miR-181a et miR-122 ont présenté une régulation positive à des moments tardifs après l'infection tandis que miR-92a, miR-23a, miR-92b-3p, miR-126-5p, miR-126-3p, miR-30d, miR-23b et miR-92c ont montré une régulation négative. Parmi les 8 miARN exprimés de manière différentielle identifiés en même temps après l'infection chez les animaux infectés par la souche virulente par rapport aux animaux infectés par sa souche atténuée, miR-126-5p, miR-92c, miR-92a, miR-30e-5p et miR-500a-5p présentaient une régulation positive alors que miR-125b, miR-451 et miR-125a étaient régulés à la baisse. Il a été démontré que tous ces miARN sont associés à des gènes cellulaires impliqués dans les voies liées à la réponse immunitaire, aux interactions virus-hôte ainsi qu'à plusieurs gènes viraux. L'étude de l'expression des miARN contribuera à une meilleure compréhension de la pathogenèse du virus de la peste porcine africaine, essentielle au développement de toute stratégie de lutte contre la maladie.

La peste porcina africana (PPA) es una enfermedad viral devastadora en expansión que actualmente amenaza a la industria porcina en todo el mundo. Los microARN son una clase de ARN no codificantes de 17-25 nucleótidos que se ha demostrado que tienen funciones críticas en una amplia variedad de procesos biológicos, como la diferenciación celular, la regulación del ciclo celular, la carcinogénesis, la apoptosis, la regulación de la inmunidad, así como en infecciones virales por escisión o represión traduccional de los ARNm. Sin embargo, no hay información sobre la expresión de miARN en una infección por VPPA. En este estudio de prueba de concepto, hemos analizado los miARN expresados en el bazo y los ganglios linfáticos submandibulares de cerdos infectados experimentalmente con una cepa de VPPA virulenta (E75) o su derivada atenuada (E75CV1), así como, en diferentes momentos posteriores a la infección con la cepa virulenta, mediante secuenciación de alto rendimiento de bibliotecas de ARN pequeñas. El bazo presentó un patrón de expresión más diferencial que los ganglios linfáticos en una infección por VPPA. De los miARN más abundantes, 12 se expresaron diferencialmente en ambos tejidos en dos momentos diferentes en animales infectados con la cepa virulenta. De estos, miR-451, miR-145-5p, miR-181a y miR-122 presentaron regulación positiva en momentos tardíos posteriores a la infección, mientras que miR-92a, miR-23a, miR-92b-3p, miR-126-5p, miR-126-3p, miR-30d, miR-23b y miR-92c mostraron regulación negativa. De los 8 miARN expresados diferencialmente identificados al mismo tiempo después de la infección en animales infectados con la cepa virulenta en comparación con animales infectados con su cepa atenuada, miR-126-5p, miR-92c, miR-92a, miR-30e-5p y miR-500a-5p presentaron regulación positiva, mientras que miR-125b, miR-451 y miR-125a estaban regulados negativamente. Se ha demostrado que todos estos miARN están asociados con genes celulares implicados en vías relacionadas con la respuesta inmune, las interacciones virus-huésped, así como con varios genes virales. El estudio de la expresión de miARN contribuirá a una mejor comprensión de la patogénesis del virus de la peste porcina africana, esencial en el desarrollo de cualquier estrategia de control de la enfermedad.

African swine fever (ASF) is a re-expanding devastating viral disease currently threatening the pig industry worldwide. MicroRNAs are a class of 17-25 nucleotide non- coding RNAs that have been shown to have critical functions in a wide variety of biological processes, such as cell differentiation, cell cycle regulation, carcinogenesis, apoptosis, regulation of immunity as well as in viral infections by cleavage or translational repression of mRNAs. Nevertheless, there is no information about miRNA expression in an ASFV infection.In this proof-of-concept study, we have analyzed miRNAs expressed in spleen and submandibular lymph node of experimentally infected pigs with a virulent (E75) or its derived attenuated (E75CV1) ASFV strain, as well as, at different times post-infection with the virulent strain, by high throughput sequencing of small RNA libraries.Spleen presented a more differential expression pattern than lymph nodes in an ASFV infection. Of the most abundant miRNAs, 12 were differentially expressed in both tissues at two different times in infected animals with the virulent strain. Of these, miR-451, miR-145-5p, miR-181a and miR-122 presented up-regulation at late times post-infection while miR-92a, miR-23a, miR-92b-3p, miR-126-5p, miR-126-3p, miR-30d, miR-23b and miR-92c showed down-regulation. Of the 8 differentially expressed miRNAs identified at the same time post-infection in infected animals with the virulent strain compared with animals infected with its attenuated strain, miR-126-5p, miR-92c, miR-92a, miR-30e-5p and miR-500a-5p presented up-regulation whereas miR-125b, miR-451 and miR-125a were down-regulated. All these miRNAs have been shown to be associated with cellular genes involved in pathways related to the immune response, virus-host interactions as well as with several viral genes.The study of miRNA expression will contribute to a better understanding of African swine fever virus pathogenesis, essential in the development of any disease control strategy.

حمى الخنازير الأفريقية (ASF) هي مرض فيروسي مدمر متجدد يهدد حاليًا صناعة الخنازير في جميع أنحاء العالم. MicroRNAs هي فئة من 17-25 من الحمض النووي الريبوزي غير المشفر للنيوكليوتيدات التي ثبت أن لها وظائف حرجة في مجموعة واسعة من العمليات البيولوجية، مثل تمايز الخلايا، وتنظيم دورة الخلية، والتسرطن، والاستماتة، وتنظيم المناعة وكذلك في الالتهابات الفيروسية عن طريق الانقسام أو القمع الانتقالي للحمض النووي الريبوزي المرسال. ومع ذلك، لا توجد معلومات حول تعبير miRNA في عدوى ASFV. في هذه الدراسة التي أثبتت صحة المفهوم، قمنا بتحليل miRNAs المعبر عنها في الطحال والعقدة الليمفاوية تحت الفك السفلي للخنازير المصابة تجريبياً بسلالة خبيثة (E75) أو سلالة ASFV الموهنة المشتقة منها (E75CV1)، وكذلك، في أوقات مختلفة بعد الإصابة بالسلالة الخبيثة، من خلال تسلسل عالي الإنتاجية لمكتبات RNA الصغيرة. قدم Spleen نمط تعبير أكثر تفاضلاً من الغدد الليمفاوية في عدوى ASFV. من بين أكثر miRNAs وفرة، تم التعبير عن 12 بشكل مختلف في كلا الأنسجة في وقتين مختلفين في الحيوانات المصابة بالسلالة الخبيثة. من بين هؤلاء، قدمت miR -451 و miR -145-5 p و miR -181a و miR -122 تنظيمًا أعلى في أوقات متأخرة بعد العدوى بينما أظهرت miR -92a و miR -23a و miR -92b -3p و miR -126-5 p و miR -126-3 p و miR -30d و miR -23b و miR -92c انخفاضًا في التنظيم. من بين 8 miRNAs التي تم التعبير عنها بشكل تفاضلي والتي تم تحديدها في نفس الوقت بعد العدوى في الحيوانات المصابة بالسلالة الخبيثة مقارنة بالحيوانات المصابة بسلالة موهنة، تم تنظيم miR -126-5 p و miR -92c و miR -92a و miR -30e -5p و miR -500a -5p في حين تم تنظيم miR -125b و miR -451 و miR -125a. وقد ثبت أن كل هذه miRNAs مرتبطة بالجينات الخلوية المشاركة في المسارات المتعلقة بالاستجابة المناعية، والتفاعلات بين الفيروس والمضيف وكذلك مع العديد من الجينات الفيروسية. ستساهم دراسة تعبير miRNA في فهم أفضل لإمراض فيروس حمى الخنازير الأفريقية، وهو أمر ضروري في تطوير أي استراتيجية لمكافحة الأمراض.