Laguna Pampa El Cabildo es una laguna costera dentro de un ecosistema de manglar y que forma parte del área natural protegida El Cabildo Amatal, por lo que su conservación debe ser una prioridad para los tres niveles de gobierno y para la sociedad. El objetivo se centró en la propuesta de construcción de un índice de complejidad ambiental de la laguna de estudio, empleando algunas variables ambientales, a partir de la estadística inferencial (p<0.05), un índice de construcción sencilla y de fácil entendimiento. Bimensualmente, durante la marea alta diurna (MAD) y marea alta nocturna (MAN), se realizaron mediciones por cuadruplicado de temperatura (°C), salinidad, oxígeno disuelto (mg/L), pH y turbidez (UNT) en 11 sitios (S) de muestreo. Se realizó un análisis descriptivo de las variables analizadas (promedio, desviación estándar, valor mínimo y valor máximo), se exploraron similitudes espacio-temporales (análisis de conglomerados) y se propuso un índice de complejidad ambiental (ICAM), teniendo como base el análisis de varianza, con niveles que van de un sistema muy heterogéneo/complejo a un sistema homogéneo/no complejo. Se registró una amplia variación promedio de los factores analizados entre meses y una menor variación entre sitios. El análisis de similitud destacó, en cuatro de las cinco variables analizadas, similitudes en los S1 y S2, sugiriendo esta área como una unidad ambiental distinta al resto de la laguna. Los ICAM calculados describen una laguna temporalmente compleja (0.25 y 0.35) y espacialmente poco compleja (0.69 y 0.79) tanto en MAD como en MAN respectivamente. Se sugiere considerar las unidades ambientales y los niveles de complejidad identificadas en este estudio, en decisiones de conservación de la laguna.