Morella pavonis es una especie nativa distribuida en el sur de Perú y en el norte de Chile, comúnmente conocida como pacama, denominada en la categoría de vulnerable. Existe escasa información sobre la germinación de semillas y hongos endófitos asociados en M. pavonis. Generar este conocimiento aportaría a desarrollar estrategias para ayudar a la preservación de esta especie. Se recolectaron frutos en cuatro localidades (Lotes) de las provincias de Arica y Tamarugal, el estudio de la morfología del fruto indicó que se compone por un endocarpio duro rodeado de cera que no inhibe el ingreso de agua, en su interior se encuentra una semilla exalbuminada, con un contenido de humedad del 22%, el test de tetrazolio evidenció la alta viabilidad en todos los lotes (75-88%). La máxima germinación se obtuvo en el Lote 4 alcanzando el 87% por la reducción del contenido de humedad, el segundo método más efectivo fue el uso de GA3 500 ppm maximizando la germinación ineficiente elevándola del 2% al 78% en el Lote 3, la estratificación fría a 4 °C incrementó la germinación en los Lotes 1 y 2 con valores finales del 28 y 33%, respectivamente, información que sugiere la existencia de dormancia fisiológica no profunda.Las semillas de Morella pavonis, además, revelaron albergar hongos endófitos, se encontró la presencia de 9 morfotipos presentes en los Lotes 3 y 4, la diversidad alfa mostró índices mayores en el Lote 4, casualmente semillas de este lote alcanzaron la máxima germinación.