El fitoplancton de aguas continentales esta representado por 15 000 especies en el mundo. En México seregistraron 1 025 especies, casi el 6.8% de las algas continentales a nivel mundial y el 33.8% de las algas continentalesde México. Estuvo representado principalmente por las clases Bacillariophyceae (31.9%), Cyanophyceae (18.24%) yChlorophyceae (17.4%). La mayoría de las especies son cosmopolitas, otras tienen afinidades tropicales y neárticas.Las regiones central y S-SE son las mejor representadas (> 100), no así la región N-NE con pocos taxa (< 2). Ochoestados del norte y 4 del S-SE permanecen sin estudios o registros. En México el descubrimiento de nuevas especiesfue realizado por europeos y americanos, los científicos mexicanos comenzaron a describir especies en 1933, pero eshasta finales del siglo XX y principios del XXI que se describen un mayor número. La falta del conocimiento de lasalgas fitoplanctónicas de México, el bajo nivel de endemismo y la perturbación de los ambientes acuáticos ponen enriesgo la sobrevivencia de esta importante comunidad. Diversas especies fitoplanctónicas han sido utilizadas comosuplementos alimenticios, antioxidantes, o para bio-remediación y biocombustibles; sin embargo, su producción enMéxico es aún muy limitada.