A promoção de concepções educativas com caráter interdisciplinar tem sido uma preocupação de muitas instituições escolares, buscando superar a perspectiva curricular que fragmenta o conhecimento em disciplinas isoladas. Nesse sentido, este estudo busca investigar a manifestação da interdisciplinaridade em salas multisseriadas que adotam a Pedagogia da Alternância no município de Colatina, na região norte do estado do Espírito Santo. Para tanto, em termos metodológicos, essa pesquisa de caráter exploratório, numa abordagem qualitativa, adota como referencial teórico as ideias de Muscardi et al. (2022), mas também os estudos sobre interdisciplinaridade, segundo Freire. A coleta de dados privilegiou a análise das orientações curriculares formuladas pelo Macrocentro (2013). Como resultado, o estudo revela que as escolas multisseriadas que adotam a Pedagogia da Alternância no município de Colatina, apesar dos desafios, desenvolvem a interdisciplinaridade em sua proposta educativa, sendo as mediações didático-pedagógicas da Pedagogia da Alternância essenciais para materializar essa intencionalidade educativa.