Introdução: Esta revisão aborda a cromatografia contracorrente, técnica utilizada para separação em que são utilizadas duas fases líquidas imiscíveis, compostas por uma mistura de solventes. As vantagens da cromatografia contracorrente frente a outras técnicas cromatográficas estão relacionadas principalmente à ausência de um suporte sólido. Metodologia: São apresentados os principais aspectos em relação à evolução da técnica, ao desenvolvimento metodológico e às aplicações a produtos naturais e na enantioseparação, relatadas em estudos publicados entre 2013 e agosto de 2016. Resultados e Discussão: A seleção do sistema de solventes bifásico é um ponto crítico do método e tem sido alvo de importantes estudos, os quais incluem também o desenvolvimento de modelos completamente teóricos para escolha do sistema de solventes ideal. As tendências observadas apontam para o uso de alcanos, já tradicionais em cromatografia contracorrente, em que podem ser adicionados agentes modificadores. Algumas inovações nos modos de eluição são descritas, como gradientes de polaridade, extrusão da fase estacionária, reciclagem de fase móvel e refinamento por zona de pH. Conclusões: O emprego da cromatografia contracorrente para a separação de produtos de origem vegetal e de enantiômeros é destacado, evidenciando o potencial desta técnica na separação de compostos com atividade biológica.