Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
addClaim

IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO GENÔMICA DE GENES DA GLUTATIONA PEROXIDASE EM (MANIHOT ESCULENTA) CRANTZ

Authors: RAFAEL DA SILVA PAIVA; ALINE MEDEIROS LIMA; ADRYANA TRABASSOS DOS SANTOS; ELIZA DE JESUS BARROS DOS SANTOS;

IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO GENÔMICA DE GENES DA GLUTATIONA PEROXIDASE EM (MANIHOT ESCULENTA) CRANTZ

Abstract

Introdução: A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é cultivada em inúmeros países apresentando grande importância socioeconômica, no entanto, a sua produção pode sofrer prejuízos econômicos quando a planta está exposta a patógenos. Nesse contexto, os vegetais em resposta ao estresse biótico recorrem a genes envolvidos a tais sinais, como o gene da peroxidase (POD) que constitui uma classe de enzimas oxidoredutases que possui a função de catalisar a oxidação do substrato utilizando o poder oxidante do peroxido de hidrogênio. Objetivo: Portanto, este estudo tem como objetivo identificar e caracterizar in silico, famílias de genes da glutationa peroxidase de mandioca (MePOD). Material e métodos: Para a metodologia este estudo utilizou as sequências de aminoácidos obtidas no programa Phytosome. Estas foram observadas quanto a presença dos domínios conservadores através do servidor InterPro, quanto a similaridade com proteínas de estruturas já descritas, utilizando a ferramenta de busca do NCBI – Blast e quanto a presença do peptídeo sinal, foi utilizado os programas SignalP e o Phorbius prediction. Resultados: Após as análises foram identificados quinze sequências de aminoácidos que possuem domínios conservadores característicos de proteínas da família da peroxidase. As sequências foram nomeadas de MePOD1 a MePOD15. Embora algumas sequências proteicas apresentem a mesma quantidade de aminoácidos como os genes MePOD5, MePOD6, MePOD7, MePOD8, MePOD10, MePOD11, MePOD12, MePOD15. Estas quando alinhadas no programa Clustaw apresentam diferenças na composição de aminoácidos apresentando com isso, diferentes isoformas. Ao observar as sequências proteicas dos quinze genes nos programas SignalP e Phorbius prediction só foi possível identificar a presença do peptídeo sinal em seis sequências de aminoácidos, os genes identificados quando analisados no programa Blast, apresentaram similaridade superior a 80% com genes que codificam proteínas de peroxidase de outros vegetais que se expressam durante os processos metabólicos. Conclusão: Conclui-se, portanto, que a família de genes da Glutationa peroxidase na mandioca possuem 15 isoformas e estas compartilham um alto grau de homologia. Porém, muitas etapas deste tipo de defesa ainda não foram totalmente estudadas por isso este trabalho visa contribuir para o preenchimento de tais lacunas nesses tipos de pesquisas.

  • BIP!
    Impact byBIP!
    selected citations
    These citations are derived from selected sources.
    This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    0
    popularity
    This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
    Average
    influence
    This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    Average
    impulse
    This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
    Average
Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
selected citations
These citations are derived from selected sources.
This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Citations provided by BIP!
popularity
This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
BIP!Popularity provided by BIP!
influence
This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Influence provided by BIP!
impulse
This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
BIP!Impulse provided by BIP!
0
Average
Average
Average
Upload OA version
Are you the author of this publication? Upload your Open Access version to Zenodo!
It’s fast and easy, just two clicks!