La coordinación motriz y el desarrollo motor son uno de los componentes esenciales a considerar en la niñez, pero, además, está asociada con el rendimiento físico y la adquisición de habilidades motrices. El estudio es relevante en Educación Física porque permite entender mejor el grado de dominio motriz que los niños y niñas muestran y la mejor forma para lograr los requisitos necesarios para permitir el desarrollo de capacidades físicas. El objetivo fue determinar la relación existente entre coordinación motriz y el nivel de desarrollo de capacidades físicas en estudiantes de sexto año de Educación Básica, Escuela “San Felipe Neri”. Se utilizó el paradigma cuantitativo y dentro de este el diseño no experimental, del tipo descriptivo-correlacional y del enfoque transversal. Participaron 64 escolares. Para la coordinación motriz, se utilizó el Test de Coordinación Corporal para Niños (KTK) y las capacidades físicas básicas fueron evaluadas mediante la batería EUROFIT. La variable de coordinación motriz no cumplió con el supuesto de normalidad y el análisis de la relación de las variables se utilizó el coeficiente de correlación no paramétrico Rho de Spearman. El grupo mostró un nivel de coordinación motriz global intermediario y con una variabilidad moderada. El análisis correlacional mostró que existe una relación positiva moderada, significativa, entre coordinación motriz y resistencia aeróbica (? = .52). Existió tránsito positivo importante para la fuerza explosiva, una relación negativa moderada con la velocidad de desplazamiento. No había relación significativa entre coordinación motriz y capacidad de flexibilidad. La coordinación motriz mantiene una relación significativa con varias capacidades físicas básicas; ejerce influencia positiva en el rendimiento físico. Esta no se manifiesta uniforme sobre todas ellas. Se enfatiza fortalecer el desarrollo de la coordinación motriz en la Educación Física escolar.