O mucua (Kinosternon scorpioides) e uma especie de extrema importância economica no Estado do Para, sendo indispensaveis estudos que viabilizem sua conservacao e sua caracterizacao genetica, a fim de direcionar programas de melhoramento nessa especie e o monitoramento da sua variabilidade. O objetivo foi avaliar a variabilidade genetica existente em populacoes de Kinosternon scorpioides do Banco de Germoplasma Animal da Amazonia Oriental (BAGAM), localizado em Salvaterra, na ilha de Marajo, no Estado do Para, a fim de realizar uma caracterizacao molecular inicial da especie. Foram utilizados marcadores moleculares RAPD (Polimorfismos de DNA Amplificados ao Acaso). Para tanto, foram obtidas amostras de DNA a partir de sangue total de 39 individuos de diferentes populacoes. A selecao de primers foi realizada a partir de um screening de quatro kits (kit OPA, OPU, OPJ, OPM), dos quais foram selecionados os doze mais polimorficos, que geraram bandas no intervalo de tres a oito, viaveis para utilizacao. A analise de similaridade genetica foi realizada com 53 marcadores RAPD, no programa NTSYS-pc, 2.0 utilizando o coeficiente de Jaccard. A partir dos dados gerados pela UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean), pode-se dimensionar a variabilidade existente entre os mesmos. Foram obtidos intervalos de similaridade genetica variando de 3-98%, sendo que os individuos mais divergentes foram o M8 e o M14 com o M33 (0,03) e os mais similares, os genotipos M3 e o M4 (0,98). Os resultados indicaram a existencia de variabilidade genetica a ser explorada na especie, tanto para programas de melhoramento genetico como para a conservacao da mesma.