Introducción: La protozoariasis tiene una alta prevalencia en diferentes regiones de nuestro país y es uno de los principales problemas, por su alta prevalencia y elevados índices de transmisibilidad, el objetivo del presente trabajo es determinar las características de la protozoariasis intestinal en edad pediátrica. Metodología: Se efectuó un estudio descriptivo, transversal y retrospectivo. Se revisaron los resultados de estudios de laboratorio de la gestión 2017 y 2018 de pacientes que acudieron al hospital San Juan de Dios del municipio de Cliza Cochabamba, Bolivia. Resultados: La frecuencia de protozoariasis fue 56.8 %, según el sexo 52,2 % mujeres y 47,8 % varones, en el grupo etario de niños menores de 1 año, 27 %, 1 a 5 58.4 %, 5 a 10, 10.3 %, 10 a 12 3 % y 12 a 15 1.3 %. La frecuencia del tipo de protozoario es Entamoeba histolytica 78.6 %, Giardia lamblia 17.6 %, Chilomastixmesnili 1.8 %, Blastocystis hominis 1.2 % y Endolimax nana 0.7 %. Discusión: Se observa una disminución en la prevalencia de estos microorganismos, considerando la mejora de los servicios básicos en la zona y educación sanitaria, siendo frecuente en el sexo femenino, y el grupo etario que presento mayor parasitosis es de 1 a 5 años, siendo la Entamoeba histolytica la de mayor presencia y no existe relación en la frecuencia de protozoariasis intestinal en relación con otros trabajos de la región.