El objetivo deeste estudio fue realizar el balance de Gases de Efecto Invernadero (GEI) en sistemas de lechería especializadosrepresentativos de la zona alta de la Región Central de Costa Rica, provincia de Cartago, ubicados en sitiosagroecológicamente diferentes, entre 1800 y 2700 m de altitud, en las coordenadas 9°94′12” y 9°89′96” latitudnorte y 83°85′15” y 83°87′80”longitud oeste, en pisos altitudinales de montano a montano bajo y zonas de vidade bosque húmedo a muy húmedo. La investigación se realizó durante un periodo de un año consecutivo (2014),utilizando la metodología propuesta por el Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC) en el 2006. Secuantificó la fijación de carbono en el suelo, en los árboles de las cercas vivas y dispersos en potreros y bosquey las emisiones de metano (CH4), óxido nitroso N2O y dióxido de carbono (CO2) generadas por los rumiantes, elestiércol, los fertilizantes nitrogenados, los combustibles fósiles y la electricidad. Se utilizó el dióxido de carbonoequivalente (CO2 eq) como unidad de medida, determinando el balance de GEI mediante la diferencia entre lacantidad CO2 eq fijado y el emitido por el sistema. Se evidenció que los sistemas de lechería especializadosevaluados, presentan un balance negativo de GEI, debido a que no fue posible cuantificar la fijación de carbonofijado en el suelo durante el corto periodo de evaluación (un año). Sin embargo, se demostró que el componenteleñoso, conformado por el área de bosque, los árboles dispersos, las pasturas y las cercas vivas, retiene másdel 50 % del carbono emitido por los mismos sistemas. Además, se concluyó que las emisiones de carbono sepodrían reducir, con una adecuada estructuración del hato, desechando los animales improductivos y optimizando la fertilización nitrogenada.