Introduccion: Los programas de ejercicio en las fuerzas armadas constituyen un tema fundamental de la capacitacion militar. Sin embargo, los metodos para evaluar el efecto de una intervencion de ejercicio en la morfologia del cuerpo son heterogeneos, con validaciones irregulares. En este estudio, consideramos al somatotipo para evaluar los efectos del entrenamiento militar basico sobre la composicion corporal en cadetes mexicanos. Material y metodos: Se midio el somatotipo de todos los cadetes (n = 70) de ingreso a la Escuela Militar de Medicina de Mexico en 2008 (hombres n = 31, mujeres n = 39), antes y despues del entrenamiento militar basico, con dos meses en longitud. Resultados: Se encontro que en la intervencion de entrenamiento en hombres, hubo aumento de la mesomorfia (p < 0.005) y la disminucion de la endomorfia (p < 0.05), sin un cambio estadisticamente significativo en la ectomorfia. El entrenamiento no produjo ningun cambio estadisticamente significativo en el somatotipo de las mujeres. Conclusiones: Nuestros resultados sugieren que el uso del somatotipo para evaluar los cambios en la composicion corporal relacionadas al entrenamiento es un metodo confiable. Discutimos la manera en que el entrenamiento fisico militar afecta a los cadetes mexicanos de una manera dependiente del sexo.