Para evaluar el efecto de localidad y fecha de siembra sobre el cruzamiento natural del frijol (Phaseolus vulgaris L.), se condujo una serie de experimentos, durante 1993 y 1994 en los Valles Altos de México. Se utilizó como marcador genético el color del hipocótilo. El estudio comprendió la selección de 10 variedades de color hipocótilo verde y cuatro de color morado; la estimación de cruzamiento, en cuatro experimentos establecidos en Montecillo y Tecámac, México, el 24 de abril y 26 de mayo de 1993 y la evaluación del cruzamiento natural basándose en el número de plántulas de hipocótilo morado en las progenies F1 de variedades de color verde. Se encontraron diferencias significativas (p ≤ 0.05) para localidad, fechas de siembra y variedades, así como en las interacciones de fecha de siembra con posición y variedad, y variedad x localidad x fecha de siembra. El cruzamiento fue significativamente superior en Tecámac (0.54 %) respecto a Montecillo, y la fecha del 24 de abril tuvo mayor cruzamiento natural (0.52 %) que la del 26 de mayo. Las 10 variedades evaluadas mostraron algún nivel de cruzamiento natural (0.86 a 4.19 %), sin embargo, las variedades con valores mayores fueron de hábito indeterminado y de ciclo intermedio a tardío, como el Bayo Mecentral (4.19 %), Bayo Gordo (3.53 %) y Manzano (3.17 %). Características relacionadas con la capacidad de cruzamiento natural de las variedades fueron hábito de crecimiento, precocidad y duración del periodo de floración. La interacción genotipo x ambiente fue de particular importancia, sobre todo con relación a la fecha de siembra.