De nombreux projets de découverte de médicaments s'appuient sur des composés commerciaux pour découvrir des pistes actives. Cependant, les bibliothèques commerciales actuelles, avec principalement des composés synthétiques, accèdent à une petite fraction de la diversité chimique possible. Les produits naturels, en revanche, possèdent une grande diversité structurelle et se sont révélés être une source exceptionnelle de nouveaux médicaments. Plusieurs analyses chimio-informatiques de produits naturels ont démontré leur diversité et leur complexité structurelle. Cependant, à notre connaissance, la teneur en échafaudage et la diversité structurelle des métabolites secondaires fongiques n'ont jamais été étudiées. Ici, la diversité de l'échafaudage de 223 métabolites fongiques a été mesurée et comparée à la diversité des médicaments approuvés et des bibliothèques commerciales pour les HTS contenant des composés naturels, synthétiques et semi-synthétiques. En outre, la diversité globale des isolats fongiques a été évaluée et comparée à d'autres ensembles de données de référence à l'aide de Consensus Diversity Plots, un outil chimio-informatique récemment développé. Il a été conclu que les métabolites secondaires fongiques sont des systèmes cycliques avec peu de ramifications et plus diversifiés que les bibliothèques commerciales avec des produits naturels et des composés semi-synthétiques. L'ensemble de données sur les métabolites fongiques était l'un des plus diversifiés sur le plan structurel, contenant une grande proportion d'échafaudages différents et uniques non trouvés dans les autres ensembles de données sur les composés, y compris ChEMBL. Par conséquent, les métabolites fongiques offrent une riche source de molécules adaptées pour identifier divers candidats à la découverte de médicaments.

Muchos proyectos de descubrimiento de fármacos se basan en compuestos comerciales para descubrir clientes potenciales activos. Sin embargo, las bibliotecas comerciales actuales, con compuestos en su mayoría sintéticos, acceden a una pequeña fracción de la posible diversidad química. Los productos naturales, por el contrario, poseen una gran diversidad estructural y han demostrado ser una fuente destacada de nuevos fármacos. Varios análisis quimioinformáticos de productos naturales han demostrado su diversidad y complejidad estructural. Sin embargo, hasta donde sabemos, el contenido de andamiaje y la diversidad estructural de los metabolitos secundarios fúngicos nunca se han estudiado. En la presente, se midió la diversidad de andamiaje de 223 metabolitos fúngicos y se comparó con la diversidad de fármacos aprobados y bibliotecas comerciales para HTS que contienen compuestos naturales, sintéticos y semisintéticos. Además, se evaluó la diversidad global de los aislados fúngicos y se comparó con otros conjuntos de datos de referencia utilizando Consensus Diversity Plots, una herramienta quimioinformática desarrollada recientemente. Se concluyó que los metabolitos secundarios fúngicos son sistemas cíclicos con pocas ramificaciones y más diversos que las bibliotecas comerciales con productos naturales y compuestos semisintéticos. El conjunto de datos de metabolitos fúngicos fue uno de los más diversos estructuralmente, conteniendo una gran proporción de andamios diferentes y únicos que no se encuentran en los otros conjuntos de datos compuestos, incluido ChEMBL. Por lo tanto, los metabolitos fúngicos ofrecen una rica fuente de moléculas adecuadas para identificar diversos candidatos para el descubrimiento de fármacos.

Many drug discovery projects rely on commercial compounds to discover active leads. However, current commercial libraries, with mostly synthetic compounds, access a small fraction of the possible chemical diversity. Natural products, in contrast, possess a vast structural diversity and have proven to be an outstanding source of new drugs. Several chemoinformatic analyses of natural products have demonstrated their diversity and structural complexity. However, to our knowledge, the scaffold content and structural diversity of fungal secondary metabolites have never been studied. Herein, the scaffold diversity of 223 fungal metabolites was measured and compared to the diversity of approved drugs and commercial libraries for HTS containing natural, synthetic, and semi-synthetic compounds. In addition, the global diversity of the fungal isolates was assessed and compared to other reference data sets using Consensus Diversity Plots, a chemoinformatic tool recently developed. It was concluded that fungal secondary metabolites are cyclic systems with few ramifications and more diverse than the commercial libraries with natural products and semi-synthetic compounds. The fungal metabolites data set was one of the most structurally diverse, containing a large proportion of different and unique scaffolds not found in the other compound data sets including ChEMBL. Therefore, fungal metabolites offer a rich source of molecules suited for identifying diverse candidates for drug discovery.

تعتمد العديد من مشاريع اكتشاف الأدوية على المركبات التجارية لاكتشاف الخيوط النشطة. ومع ذلك، فإن المكتبات التجارية الحالية، التي تحتوي في الغالب على مركبات اصطناعية، تصل إلى جزء صغير من التنوع الكيميائي المحتمل. وعلى النقيض من ذلك، تمتلك المنتجات الطبيعية تنوعًا هيكليًا كبيرًا وأثبتت أنها مصدر متميز للعقاقير الجديدة. أظهرت العديد من التحليلات المعلوماتية الكيميائية للمنتجات الطبيعية تنوعها وتعقيدها الهيكلي. ومع ذلك، على حد علمنا، لم يتم دراسة محتوى السقالة والتنوع الهيكلي للمستقلبات الثانوية الفطرية. وهنا تم قياس تنوع السقالة من 223 مستقلب فطري ومقارنتها بتنوع الأدوية المعتمدة والمكتبات التجارية لهيئة تحرير الشام التي تحتوي على مركبات طبيعية واصطناعية وشبه اصطناعية. بالإضافة إلى ذلك، تم تقييم التنوع العالمي للعزلات الفطرية ومقارنتها بمجموعات البيانات المرجعية الأخرى باستخدام مخططات تنوع الإجماع، وهي أداة معلوماتية كيميائية تم تطويرها مؤخرًا. تم التوصل إلى أن المستقلبات الثانوية الفطرية هي أنظمة دورية ذات تداعيات قليلة وأكثر تنوعًا من المكتبات التجارية التي تحتوي على منتجات طبيعية ومركبات شبه اصطناعية. كانت مجموعة بيانات المستقلبات الفطرية واحدة من أكثر مجموعات البيانات تنوعًا من الناحية الهيكلية، حيث تحتوي على نسبة كبيرة من السقالات المختلفة والفريدة غير الموجودة في مجموعات البيانات المركبة الأخرى بما في ذلك ChEMBL. لذلك، توفر المستقلبات الفطرية مصدرًا غنيًا بالجزيئات المناسبة لتحديد المرشحين المتنوعين لاكتشاف الأدوية.