Ograniczenie sposobu korzystania z nieruchomości w związku z ochroną zasobów środowiska może nastąpić przez poddanie ochronie obszarów lub obiektów na podstawie przepisów ustawy o ochronie przyrody lub wyznaczenie obszarów cichych w aglomeracji oraz obszarów cichych poza aglomeracją. Właściciel takiej nieruchomości, z której korzystanie lub jej części w dotychczasowy sposób lub zgodny z przeznaczeniem stało się niemożliwe lub istotnie ograniczone, może żądać wykupienia nieruchomości lub jej części. Drugą możliwością, którą posiada właściciel takiej nieruchomości, jest możliwość żądania odszkodowania za poniesioną szkodę, w tym za zmniejszenie wartości nieruchomości. Celem artykułu było przeanalizowanie możliwości ograniczenia korzystania z nieruchomości w wyniku procedury oceny oddziaływania na obszar Natura 2000, w tym żądania z tego tytułu odszkodowania. Do tej pory w doktrynie jak i w orzecznictwie zagadnienie to w tym kontekście nie było szerzej analizowane. Analiza przepisów i orzecznictwa wykazała, że w przypadku, gdy ograniczenie sposobu korzystania z nieruchomości lub jej części wynika z indywidualnego postępowania administracyjnego, prawo żądania wykupu całości lub części nieruchomości albo żądania odszkodowania nie wynika literalnie wprost z obecnie obowiązujących przepisów prawnych. W celu wyeliminowania tej luki prawnej, zaproponowano możliwe sposoby nowelizacji przepisów prawnych.