El microbioma intestinal es un ecosistema complejo y dinámico de microorganismos que desempeña un papel crucial en la regulación del sistema inmunológico. Las investigaciones han mostrado una relación significativa entre la composición y diversidad del microbioma intestinal y el desarrollo de enfermedades autoinmunes, como la artritis reumatoide, el lupus eritematoso sistémico, la enfermedad inflamatoria intestinal y la esclerosis múltiple. Los desequilibrios en el microbioma, conocidos como disbiosis, pueden alterar la tolerancia inmunológica y provocar respuestas inflamatorias que perpetúan las enfermedades autoinmunes. Factores como la dieta, el uso de antibióticos, el estrés y la genética influyen en la composición del microbioma y, por ende, en el riesgo de desarrollar estas enfermedades. Además, el eje intestino-cerebro, un canal bidireccional de comunicación entre el microbioma y el sistema nervioso central, también juega un papel clave en enfermedades neuro inmunológicas. Los estudios actuales sugieren que intervenir en el microbioma mediante probióticos, prebióticos, trasplante de microbiota fecal y dietas específicas podría ser una estrategia prometedora para prevenir y tratar enfermedades autoinmunes. Este artículo revisa la evidencia científica sobre el impacto del microbioma intestinal en las enfermedades autoinmunes, destacando sus mecanismos subyacentes y las posibles estrategias terapéuticas.