Las principales acciones para promover el rescate, conservación e investigación del cacao en México se realizan mediante el mejoramiento participativo para resistencia a enfermedades, como la moniliasis, enfermedad que ha mermado considerablemente el rendimiento en las zonas cacaoteras de México y el mundo, y se constituye como amenza a la diversidad genética del cacao mexicano. Se intervinieron las comunidades cacaoteras de Chiapas y San Bartolomé Loxicha, Oaxaca para seleccionar más de 24 materiales promisorios para un programa de mejoramiento participativo, quedando finalmente tres tipos seleccionados por alto rendimiento y tolerancia a moniliasis (Moniliophthera roreri), otro con tolerancia intermedia y calidad, y un criollo de alto rendimiento y alta calidad.