Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/ Agingarrow_drop_down
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
Aging
Article . 2023 . Peer-reviewed
Data sources: Crossref
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
Aging
Article . 2023
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
https://dx.doi.org/10.60692/2s...
Other literature type . 2023
Data sources: Datacite
https://dx.doi.org/10.60692/8m...
Other literature type . 2023
Data sources: Datacite
versions View all 5 versions
addClaim

Immune infiltration and immunophenotyping in atrial fibrillation

الارتشاح المناعي والتنميط الظاهري المناعي في الرجفان الأذيني
Authors: Yuqing Tian; Shiying Liu; Yanan Zhang; Jiefu Yang; Peiyao Guo; Hongchao Zhang; Yu Xue; +1 Authors

Immune infiltration and immunophenotyping in atrial fibrillation

Abstract

La fibrillation auriculaire (FA) est une arythmie relativement fréquente dans la pratique clinique. Bien que des progrès significatifs aient été réalisés dans le traitement de la FA et de ses complications associées, la recherche sur la prévention de la FA est à la traîne, principalement en raison du manque de compréhension approfondie de la pathogenèse de la FA. Au cours des dernières années, à mesure que nos connaissances se sont développées, le rôle de la réponse inflammatoire/immunitaire dans la survenue et la progression de la FA a progressivement attiré l'attention. Dans cet article, basé sur les données d'expression génique existantes dans la base de données Gene Expression Omnibus, une description détaillée du statut d'infiltration immunitaire dans la FA est présentée à l'aide d'une série de méthodes analytiques, notamment l'analyse différentielle, la catégorisation de l'ontologie génique, l'analyse de l'enrichissement de l'Encyclopédie de Kyoto des gènes et des génomes, l'analyse du réseau de coexpression génique pondérée et des outils d'analyse tels que CIBERSORTx et Cytoscape. Plusieurs nouveaux gènes de signature liés à la FA/aux infiltrations immunitaires ont été identifiés, et la pathologie de la FA/des infiltrations immunitaires a été classée en fonction de ces gènes de signature immunitaires, fournissant ainsi de nouvelles informations sur la pathogenèse de la FA en fonction de la réponse inflammatoire.

La fibrilación auricular (FA) es una arritmia relativamente común en la práctica clínica. Aunque se han logrado avances significativos en el tratamiento de la FA y sus complicaciones asociadas, la investigación sobre la prevención de la FA está rezagada, principalmente debido a la falta de un conocimiento profundo de la patogénesis de la FA. En los últimos años, a medida que nuestro conocimiento ha crecido, el papel de la respuesta inflamatoria/inmune en la aparición y progresión de la FA ha ido ganando atención gradualmente. En este artículo, basado en los datos de expresión génica existentes en la base de datos Gene Expression Omnibus, se presenta una descripción detallada del estado de infiltración inmune en la FA utilizando una serie de métodos analíticos, que incluyen análisis diferencial, categorización de ontología génica, análisis de enriquecimiento de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto y análisis de redes de coexpresión génica ponderada, y herramientas de análisis como CIBERSORTx y Cytoscape. Se identificaron varios genes distintivos relacionados con la FA/infiltraciones inmunitarias, y la patología de la FA/infiltración inmunitaria se clasificó en función de estos genes distintivos inmunitarios, proporcionando así nuevos conocimientos sobre la patogénesis de la FA en función de la respuesta inflamatoria.

Atrial fibrillation (AF) is a relatively common arrhythmia in clinical practice. Although significant progress has been achieved in the treatment of AF and its associated complications, research on AF prevention lags behind, mainly due to the lack of a deep understanding of AF pathogenesis. In recent years, as our knowledge has grown, the role of the inflammatory/immune response in the occurrence and progression of AF has gradually gained attention. In this paper, based on existing gene expression data in the Gene Expression Omnibus database, a detailed description of immune infiltration status in AF is presented using a series of analytical methods, including differential analysis, Gene Ontology categorization, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes enrichment analysis, and weighted gene coexpression network analysis, and analysis tools such as CIBERSORTx and Cytoscape. Several new AF/immune infiltrations-related signature genes were identified, and the AF/immune infiltration pathology was classified based on these immune signature genes, thus providing novel insights into the pathogenesis of AF based on the inflammatory response.

الرجفان الأذيني هو اضطراب نظم شائع نسبيًا في الممارسة السريرية. على الرغم من إحراز تقدم كبير في علاج الرجفان الأذيني والمضاعفات المرتبطة به، إلا أن الأبحاث حول الوقاية من الرجفان الأذيني متخلفة، ويرجع ذلك أساسًا إلى عدم وجود فهم عميق للتسبب في الرجفان الأذيني. في السنوات الأخيرة، مع نمو معرفتنا، اكتسب دور الاستجابة الالتهابية/المناعية في حدوث وتطور الرجفان الأذيني الاهتمام تدريجياً. في هذه الورقة، استنادًا إلى بيانات التعبير الجيني الموجودة في قاعدة بيانات التعبير الجيني الشامل، يتم تقديم وصف مفصل لحالة التسلل المناعي في الرجفان الأذيني باستخدام سلسلة من الأساليب التحليلية، بما في ذلك التحليل التفاضلي، وتصنيف علم الوجود الجيني، وموسوعة كيوتو للجينات وتحليل إثراء الجينوم، وتحليل شبكة التعبير الجيني المرجح، وأدوات التحليل مثل CIBERSORTx و Cytoscape. تم تحديد العديد من الجينات المميزة الجديدة المتعلقة بالرجفان الأذيني/الارتشاح المناعي، وتم تصنيف أمراض الرجفان الأذيني/الارتشاح المناعي بناءً على هذه الجينات المميزة المناعية، مما يوفر رؤى جديدة حول التسبب في الرجفان الأذيني بناءً على الاستجابة الالتهابية.

Related Organizations
Keywords

FOS: Computer and information sciences, Bioinformatics, Immunological Mechanisms in Atherosclerosis Development, Immunology, Pathogenesis, Adaptive Immunity, Gene, Immunophenotyping, Computational biology, Atrial Fibrillation, Health Sciences, Genetics, Humans, Gene Regulatory Networks, Flow cytometry, Biology, Internal medicine, Immunology and Microbiology, FOS: Clinical medicine, Life Sciences, Atrial fibrillation, Gene expression profiling, Cholesterol-lowering Treatment, Immune system, FOS: Biological sciences, KEGG, Medicine, Surgery, Gene expression, Cardiology and Cardiovascular Medicine, Transcriptome, Research Paper

  • BIP!
    Impact byBIP!
    selected citations
    These citations are derived from selected sources.
    This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    3
    popularity
    This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
    Top 10%
    influence
    This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    Average
    impulse
    This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
    Average
Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
selected citations
These citations are derived from selected sources.
This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Citations provided by BIP!
popularity
This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
BIP!Popularity provided by BIP!
influence
This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Influence provided by BIP!
impulse
This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
BIP!Impulse provided by BIP!
3
Top 10%
Average
Average
Green
gold