Las pteridofitas han sido estudiadas en sus inicios principalmente con base en la morfología del esporofito, en la que descansan las principales clasificaciones. Como resultado de los avances en otras disciplinas, y las mejoras tecnológicas en sistemas de observación y técnicas de laboratorio, en nuestros días hay una clara y evidente interrelación disciplinaria que ha llevado a revisar viejos conceptos con la consecuente modificación de ideas y teorías de la biología de las pteridofitas. En este artículo se pretende mostrar el desarrollo de la taxonomía, desde sus inicios hasta los diversos enfoques con que son abordados en la actualidad los problemas que plantea. Para ello se hará mención de las principales líneas de trabajo que se siguen, así como las contribuciones más importantes en cada campo de investigación.