
pmid: 18166076
pmc: PMC2230685
la biologie informatique est une science interdisciplinaire issue de domaines aussi disparates que les mathématiques, la chimie, les statistiques, la physique, la biologie et l'informatique. Bien que la définition exacte de la biologie informatique soit loin d'être précise et sans ambiguïté, il est un fait que des centaines de scientifiques du monde entier utilisent de plus en plus les compétences des domaines susmentionnés pour aborder différentes questions biologiques. Notre objectif n'est pas d'élucider ici la définition de la biologie informatique et ses différences avec des domaines connexes tels que la bioinformatique. de cette discipline en Argentine, nous avons besoin au moins d'une définition de travail. En ce sens, toute recherche interdisciplinaire dans laquelle l'intérêt principal est d'étudier des problèmes biologiques et où l'hypothèse de travail peut être testée au moyen de simulation et de modélisation computationnelle sera considérée comme appartenant au domaine de la biologie computationnelle ou au moins comme employant une approche de biologie computationnelle. Il est intéressant de noter que la recherche en biologie computationnelle peut être mise en œuvre de deux manières différentes selon la façon dont la nature « interdisciplinaire » de ce domaine est assemblée. main, un scientifique ayant une formation formelle dans un domaine donné (par exemple, un biologiste moléculaire) pourrait acquérir d'autres compétences (telles que la programmation ou la formation mathématique) dans sa tentative de répondre à une question biologique donnée. Alternativement, des équipes de travail composées de membres spécialisés dans différents domaines peuvent travailler ensemble pour parvenir à une explication scientifique d'un problème. Nous pensons que la première approche est plus courante au sein de la communauté scientifique car elle dépend entièrement du désir du scientifique de découvrir une explication à ses problèmes et de sa capacité à explorer différents domaines de la science.La deuxième approche dépend généralement de la disponibilité de programmes de recherche et développement, financés par des ressources publiques ou privées, qui favorisent les collaborations entre différentes institutions de recherche pour former des équipes multidisciplinaires.Nous verrons que la première approche est plus courante en Argentine.Cet article résume l'état de l'art de la biologie computationnelle en Argentine.Notre objectif est d'offrir une vision aussi large que possible des différents groupes de scientifiques et de leurs principaux intérêts de recherche.En outre, nous présentons un bref examen des politiques d'éducation, de recherche et de développement liées au domaine. Nous espérons que cet examen encouragera les chercheurs étrangers à contacter et à collaborer avec des équipes argentines, ainsi qu'à organiser et à faciliter l'échange d'informations entre les chercheurs de notre pays. Cependant, cet examen sera probablement loin d'être complet, en raison du manque d'informations centralisées sur la biologie computationnelle, et pour cette raison, nous nous excusons pour toute omission potentielle.
la biología computacional es una ciencia interdisciplinaria creada a partir de campos tan dispares como las matemáticas, la química, la estadística, la física, la biología y la informática. Aunque la definición exacta de la biología computacional está lejos de ser precisa e inequívoca, es un hecho que cientos de científicos de todo el mundo han estado utilizando cada vez más las habilidades de los campos antes mencionados para abordar diferentes preguntas biológicas. No es nuestro objetivo dilucidar aquí la definición de biología computacional y sus diferencias de campos relacionados como la bioinformática. Sin embargo, revisar el estado de esta disciplina en Argentina, necesitamos al menos una definición de trabajo. En este sentido, cualquier investigación interdisciplinaria en la que el interés principal esté en estudiar problemas biológicos y donde la hipótesis de trabajo pueda probarse mediante simulación y modelado computacional se considerará como perteneciente al campo de la biología computacional o al menos como empleando un enfoque de biología computacional. Es interesante observar que la investigación en biología computacional puede implementarse de dos maneras diferentes dependiendo de cómo se monte la naturaleza ''interdisciplinaria'' 'de este campo. En uno mano, un científico con formación formal en un campo determinado (por ejemplo, un biólogo molecular) podría adquirir otras habilidades (como programación o formación matemática) en su intento de responder a una pregunta biológica determinada. Alternativamente, los equipos de trabajo formados por miembros especializados en diferentes campos pueden trabajar juntos para llegar a una explicación científica de un problema. Creemos que el primer enfoque es más común entre la comunidad científica porque depende enteramente del deseo del científico de descubrir una explicación para sus problemas y de su capacidad para explorar diferentes áreas de la ciencia. El segundo enfoque depende generalmente de la disponibilidad de programas de investigación y desarrollo, financiados con recursos públicos o privados, que favorezcan las colaboraciones entre diferentes instituciones de investigación para formar equipos multidisciplinarios. Veremos que el primer enfoque es más común en Argentina. Este artículo resume el estado del arte de la biología computacional en Argentina. Nuestro objetivo es ofrecer una visión lo más amplia posible de los diferentes grupos de científicos y sus principales intereses de investigación. También, presentamos un breve revisión de las políticas educativas, de investigación y desarrollo relacionadas con el campo. Esperamos que esta revisión pueda alentar a los investigadores extranjeros a contactar y colaborar con los equipos argentinos, así como a organizar y facilitar el intercambio de información entre los investigadores de nuestro país. Sin embargo, esta revisión probablemente esté lejos de completarse, debido a la falta de información centralizada sobre biología computacional, y por esta razón nos disculpamos por cualquier posible omisión.
omputational biology is an interdisciplinary science bred from fields as disparate as mathematics, chemistry, statistics, physics, biology, and computer science.Although the exact definition of computational biology is far from being precise and unambiguous, it is a fact that hundreds of scientists around the world have been increasingly using skills from the above-mentioned fields to approach different biological questions.It is not our aim to elucidate here the definition of computational biology and its differences from related fields such as bioinformatics.However, to review the state of this discipline in Argentina, we need at least a working definition.In this sense, any interdisciplinary research in which the main interest is in studying biological problems and where the working hypothesis can be tested by means of simulation and computational modeling will be considered as belonging to the computational biology field or at least as employing a computational biology approach.It is interesting to note that computational biology research can be implemented in two different ways depending on how the ''interdisciplinary'' nature of this field is assembled.On one hand, a scientist with formal training in a given field (for example, a molecular biologist) could acquire other skills (such as programming or mathematical training) in his attempt to answer a given biological question.Alternatively, working teams made up of members specializing in different fields may work together to reach a scientific explanation of a problem.We think that the first approach is more common among the scientific community because it depends entirely on the scientist's desire to discover an explanation for their problems and on their capacity to explore different areas of science.The second approach is generally dependent on the availability of research and development programs, funded by public or private resources, that favor collaborations between different research institutions to form multidisciplinary teams.We will see that the first approach is more common in Argentina.This paper summarizes the state of the art of computational biology in Argentina.Our aim is to offer as broad a view as possible of the different groups of scientists and their main research interests.Also, we present a brief review of educational, research, and development policies related to the field.We hope that this review may encourage overseas researchers to contact and collaborate with Argentinean teams, as well as organizing and facilitating the exchange of information between researchers in our country.However, this review will probably be far from complete, due to the lack of centralized information on computational biology, and for this reason we apologize for any potential omissions.
علم الأحياء الحسابي هو علم متعدد التخصصات نشأ من مجالات متباينة مثل الرياضيات والكيمياء والإحصاء والفيزياء وعلم الأحياء وعلوم الكمبيوتر. على الرغم من أن التعريف الدقيق لعلم الأحياء الحسابي بعيد كل البعد عن أن يكون دقيقًا ولا لبس فيه، إلا أن الحقيقة هي أن مئات العلماء في جميع أنحاء العالم يستخدمون بشكل متزايد المهارات من المجالات المذكورة أعلاه للتعامل مع الأسئلة البيولوجية المختلفة. ليس هدفنا هنا توضيح تعريف علم الأحياء الحسابي واختلافاته عن المجالات ذات الصلة مثل المعلوماتية الحيوية. ومع ذلك، لمراجعة الحالة من هذا التخصص في الأرجنتين، نحتاج على الأقل إلى تعريف عملي. وبهذا المعنى، فإن أي بحث متعدد التخصصات يكون فيه الاهتمام الرئيسي هو دراسة المشاكل البيولوجية وحيث يمكن اختبار فرضية العمل عن طريق المحاكاة والنمذجة الحسابية سيتم اعتبارها تنتمي إلى مجال علم الأحياء الحسابي أو على الأقل تستخدم نهج علم الأحياء الحسابي. ومن المثير للاهتمام أن نلاحظ أنه يمكن تنفيذ أبحاث علم الأحياء الحسابي بطريقتين مختلفتين اعتمادًا على كيفية تجميع الطبيعة "متعددة التخصصات" لهذا المجال. من ناحية، يمكن لعالم حاصل على تدريب رسمي في مجال معين (على سبيل المثال، عالم أحياء جزيئي) اكتساب مهارات أخرى (مثل البرمجة أو التدريب الرياضي) في محاولته للإجابة على سؤال بيولوجي معين. بدلاً من ذلك، قد تعمل فرق العمل المكونة من أعضاء متخصصين في مجالات مختلفة معًا للوصول إلى تفسير علمي للمشكلة. نعتقد أن النهج الأول هو أكثر شيوعًا بين المجتمع العلمي لأنه يعتمد كليًا على رغبة العالم في اكتشاف تفسير لمشاكله وعلى قدرته على استكشاف مجالات العلوم المختلفة. يعتمد النهج الثاني عمومًا على توافر برامج البحث والتطوير، الممولة من الموارد العامة أو الخاصة، التي تفضل التعاون بين المؤسسات البحثية المختلفة لتشكيل فرق متعددة التخصصات. سنرى أن النهج الأول أكثر شيوعًا في الأرجنتين. تلخص هذه الورقة حالة فن البيولوجيا الحاسوبية في الأرجنتين. هدفنا هو تقديم رؤية واسعة قدر الإمكان للمجموعات المختلفة من العلماء واهتماماتهم البحثية الرئيسية. كما نقدم موجزًا مراجعة سياسات التعليم والبحث والتطوير المتعلقة بهذا المجال. نأمل أن تشجع هذه المراجعة الباحثين الأجانب على الاتصال والتعاون مع الفرق الأرجنتينية، بالإضافة إلى تنظيم وتسهيل تبادل المعلومات بين الباحثين في بلدنا. ومع ذلك، من المحتمل أن تكون هذه المراجعة بعيدة عن الاكتمال، بسبب نقص المعلومات المركزية حول البيولوجيا الحسابية، ولهذا السبب نعتذر عن أي سهو محتمل.
Universities, QH301-705.5, Research, Genome Evolution and Polyploidy in Plants, Argentina, Life Sciences, Computational Biology, Challenges and Innovations in Bioinformatics Education, Evolutionary biology, Genomics, Plant Science, Agricultural and Biological Sciences, Computational biology, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Biology (General), RNA Sequencing Data Analysis, Molecular Biology, Biology, Perspectives
Universities, QH301-705.5, Research, Genome Evolution and Polyploidy in Plants, Argentina, Life Sciences, Computational Biology, Challenges and Innovations in Bioinformatics Education, Evolutionary biology, Genomics, Plant Science, Agricultural and Biological Sciences, Computational biology, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Biology (General), RNA Sequencing Data Analysis, Molecular Biology, Biology, Perspectives
| selected citations These citations are derived from selected sources. This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | 4 | |
| popularity This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network. | Average | |
| influence This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | Average | |
| impulse This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network. | Average |
