Resumen Objetivo Valorar in vivo los efectos en la cornea del tratamiento con cross-linking. Metodos Dieciocho ojos de 18 pacientes con queratocono fueron tratados con cross-linking mediante el uso de solucion de rivoflavina al 0,1% y radiados con luz ultravioleta A radiados a 370 nm, 3mW/cm2 por 30 min. Se realizo microscopia confocal in vivo previo al tratamiento y a la semana y al mes despues de la aplicacion de cross-linking. Resultados A la semana del tratamiento se encontro activacion de queratocitos y organizacion de las fibras de colagena, observandose como estructuras hiperreflecticas desde la primera imagen subepitelial, hasta una profundidad del estroma corneal de 275,1 ± 85,9 μm. Al mes del tratamiento se observaron queratocitos activados, asi como organizacion de las fibras de colageno desde la primera imagen subepitelial, hasta una profundidad del estroma corneal de 324,9 ± 66,0 μm. Al mes del tratamiento, las estructuras hiperreflecticas mas profundas se mostraron en forma de lineas gruesas hiperreflecticas. Conclusiones La microscopia confocal in vivo en humanos tratados con cross-linking mostro cambios estromales a la semana y al mes del tratamiento, excediendo la profundidad de 300 μm en algunos casos.