Resumen Introduccion Los programas para cribado neonatal utilizan muestras de sangre impregnada en papel, en ellas se determinan los marcadores de las patologias incluidas. La presencia de anticoagulantes en las muestras puede producir interferencias en los metodos de medida y se recomienda su no utilizacion. No es posible reconocer las muestras recogidas con anticoagulante. Material y metodos Se desarrollo y optimizo un procedimiento por espectrometria de masas en tandem con electrospray (ESI-MS/MS) para la determinacion de EDTA (acido etilendiaminotetraacetico) en las muestras de sangre en papel y se valoro su inclusion en el perfil de aminoacidos y acilcarnitinas utilizado para la deteccion precoz neonatal de enfermedades metabolicas. Se estudio su influencia sobre las medidas de tirotropina (TSH), realizadas para el cribado neonatal de hipotiroidismo congenito. Resultados Se optimizaron los parametros que permiten la medida de EDTA en el eluato de sangre. Se ha determinado TSH en sangre en papel, suero y plasma de un grupo de 110 muestras y EDTA en otro grupo de 2.300 muestras provenientes del programa de cribado neonatal detectando su presencia en un 0,74% de las mismas. Conclusiones El metodo desarrollado es valido para la determinacion de este anticoagulante y se puede incluir en el perfil de aminoacidos y acilcarnitinas por MS/MS para detectar aquellas muestras que se extrajeron inadecuadamente. Se ha confirmado la influencia negativa del EDTA en la determinacion de TSH mediante un fluoroinmunoensayo (AutoDELFIA ® ). Esto podria provocar un falso negativo en el cribado neonatal de hipotiroidismo congenito.