Sistemele de stocare, odată cu evoluția timpului, au devenit mai complexe și dinamice, iar nevoia de stocare a datelor a crescut la fel și alegerea unei baze de date care să corespundă tuturor cerințelor, a devenit cam dificilă. MyISAM si InnoDB sunt două motoare de stocare din MySQL cel mai utilizate. Pentru îmbunătățirea performanțelor bazelor de date, este necesar de a cunoaște diferențele dintre diverse motoare de căutare și de stocare a datelor. MyISAM este un motor de stocare implicit, care mai târziu a fost înlocuit cu InnoDB. MyISAM se bazează pe algoritmul ISAM care afișează mai rapid rezultatul din seturi de date mai mari. Fiecare sistem de stocare a datelor are diverse utilizări: MyISAM este mai potrivit pentru depozitarea de date cu volume mici și aplicațiile web, iar InnoDB este mai potrivit pentru o bază de date mai mare, deoarece acceptă tranzacții de volum.