В условиях невостребованности инноваций ключевая роль в развитии и становлении национальной инновационной системы принадлежит государству. Роль государства в этом процессе, в статье рассмотрена на примере формирования национальной нанотехнологической сети. Государственная поддержка ориентирована на создание условий инфраструктурной и финансовой поддержки субъектов инновационной деятельности, а также создание и поддержание легитимных институциональных основ инновационной деятельности. В работе подчеркивается, что необходима скрупулезная проектная проработка организационной системы, которая позволит с приемлемой степенью эффективности обеспечить цели нанотехнологической инициативы. Авторы разделяют точку зрения, что для реализации этой программы потребуются гигантские усилия в создании принципиально новой для нашей страны организационной системы – национальной нанотехнологической сети, которая будет способна интегрировать разнородные экономические объекты, государственные институты, инновационные, образовательные и производственные процессы в сфере нанотехнологий и наноиндустрии. Осуществление подобной программы немыслимо без преодоления институциональной, организационной и технологической разобщенности. В настоящей статье сделана попытка более подробно и полно отразить вопросы, связанные: с назначением и целью формирования национальной нанотехнологической сети (ННС); с задачами создания организационной системы ННС; с принципами организации ННС; со структурой и функциями ННС, т.е. с проблемами организации национальной нанотехнологической сети, как целостной системы