Aim: to compare two methods of S. pneumoniae typing: classic serological method and the multiplex polymerase chain reaction (M-PCR) assay modified in accordance to the data on serotypes circulating in Russian Federation. Materials and methods: 420 pneumococcal isolates mainly from non-sterile loci were analyzed. After microbiological identification, pneumococci were serologically typed by specific antisera produced by Staten Serum Institute (Denmark) in latex agglutination test and/or capsular swelling method. In parallel, we performed series of the M-PCR, which consisted of 7 consecutive reactions at the most. Results: serotype was identified by the serological method in all 420 strains of S. pneumoniae; in total, we determined 34 different serotypes. By the means of the M-PCR, we succeeded in identification of 95% (399/420) examined strains, and 90% of them were typed in the first 3 reactions. All isolates failed to be typed by M-PCR (n = 21) had serotypes that were not included into the composition of the M-PCR. The result of serological and molecular typing was identical in 99,2% (396/399) of the isolates; 3 strains showed contradictory results: serotype 19A was determined by the serological assay and serotype 19F — by M-PCR. Conclusions: the proposed modification of M-PCR allows correct identification of serotype in more than 90% of pneumococcal strains circulating in the Russian Federation, including all serotypes of pneumococcal polysaccharide conjugate vaccines.

Цель исследования: сравнить классический серологический метод и метод молекулярного типирования S. pneumoniae с помощью мультиплексной полимеразной цепной реакции (М-ПЦР), модифицированной в соответствии с данными о циркулирующих в Российской Федерации серотипах. Материалы и методы: всего протестировано 420 изолятов пневмококка, преимущественно из нестерильных локусов. После микробиологической идентификации пневмококки серотипировали с помощью специфических антисывороток производства Statens Serum Institut (Дания) в реакциях латекс-агглютинации и/или набухания капсулы. Параллельно проводили серию М-ПЦР, максимально состоявшую из 7 последовательных реакций. Результаты: серологическим методом серотип определили у всех 420 штаммов S. pneumoniae; всего было идентифицировано 34 различных серотипа. При помощи М-ПЦР удалось типировать 95% (399/420) исследованных штаммов, причем 90% было типировано в первых трех М-ПЦР. Все ПЦР-нетипируемые изоляты (n = 21) обладали серотипами, которые не входили в состав М-ПЦР. Результаты серологического и молекулярного типирования совпали у 99,2% (396/399) изолятов; 3 штамма показали противоречивые результаты: серологическим методом у них определили серотип 19А, а методом ПЦР — 19F. Выводы: предложенная модификация М-ПЦР позволяет правильно определить серотип более чем у 90% циркулирующих в Российской Федерации штаммов пневмококка, включая все серотипы, входящие в состав полисахаридных конъюгированных пневмококковых вакцин.