Данная статья посвящена исследованию практических аспектов инновационной концепции управления экономическими системами в промышленности – интегрированному контроллингу. В статье представлен авторский подход к формированию методики управления отклонениями в системе интегрированного контроллинга. Проведен анализ существующих зарубежных и отечественных разработок обозначенной проблемы. Обоснована логическая структура методики реализации корректирующих управленческих процедур для достижения заданных значений целевых параметров управления. Полученные результаты могут быть использованы в качестве прикладного инструментария реализации концепции интегрированного контроллинга.