Стаття присвячена дослідженню митних та податкових ризиків впровадження в Україні Національної стратегії доходів. Узагальнено нормативно-правові акти, якими регламентується стратегічний розвиток митних та податкових органів. Доведено, що до прийняття Національної стратегії доходів в Україні були відсутніми стратегічні орієнтири митної та податкової політики держави, незважаючи на реалізацію Україною завдань Угоди про асоціацію з ЄС. Узагальнено основі проблеми й ризики Національної стратегії доходів за такими стратегічними цілями як: Податкове адміністрування, Митне адміністрування, Податкова політика, Митна політика. На основі виявлених митних та податкових ризиків обґрунтовано основні шляхи їх вирішення, які пов’язані із законодавчим врегулюванням та удосконаленням існуючих норм митного та податкового законодавства.