Изучение особенностей инфекционной заболеваемости, особенно в период распространения новой коронавирусной инфекции, приобретает особую актуальность при организации медицинской помощи населению и обеспечении противоэпидемической безопасности. Проведено сплошное исследование инфекционной заболеваемости детей 0–17 лет в Санкт-Петербурге в 2016–2020 годах. Оценке подлежали показатели инфекционной заболеваемости детского населения по группам инфекционных болезней и отдельным нозологиям, по различным возрастам, условиям проживания и группам районов города. Выявлены различия в санитарном состоянии внешней среды в районах Санкт-Петербурга, такие как химическая загрязненность поверхностных вод в промышленных и центральных районах, увеличение неудовлетворительных проб по бактериальной загрязненности, особенно в историческом центре, неудовлетворительная ситуация по химической загрязненности почв в промышленных и спальных районах. За период наблюдения отмечалось снижение общей инфекционной заболеваемости среди детей в городе, только в 2018 и 2019 годах зафиксирован подъем данного показателя в пригородных районах. Наибольший уровень заболеваемости кишечными инфекциями отмечен в спальных районах, наименьший — в пригородных. При сохранении общего тренда на уменьшение заболеваемости острым вирусным гепатитом отмечалось ее увеличение в промышленных и пригородных районах в 2017 и 2018 годах. Наибольшие показатели заболеваемости гриппом были в спальных районах, наименьшие — в историческом центре. Во всех группах районов города в 2020 году по сравнению с 2019 годом зафиксирован рост заболеваемости вирусной пневмонией, наиболее значимый — в промышленных и пригородных районах. Общая заболеваемость инфекциями, передающимися преимущественно половым путем, в 2020 году в целом в городе уменьшилась, однако в спальных, промышленных и центральных районах отмечался рост заболеваемости гонококковой инфекцией. Изучение особенностей формирования инфекцонной заболеваемости будет способствовать оптимизации организационных и противоэпидемических мероприятий.