La electroforesis capilar (CE) es una técnica de separación basada en la diferente velocidad de migración de las distintas especies cargadas bajo la acción de un campo eléctrico. La separación se lleva a cabo en un capilar de sílice fundida de diámetro muy pequeño ( 10-200 ¿m). El uso de estos capilares tiene múltiples ventajas: a) los capilares son anticonvectivos en sí mismos, por lo tanto, no es necesaria la utilización de un gel soporte como medio; b) el calor generado al pasar la corriente eléctrica (efecto Joule), que daría lugar a problemas de gradientes de temperatura no uniformes ( cambios locales de viscosidad ), es fuertemente reducido, ya que la disipación de calor es muy efectiva; c) pueden aplicarse altos voltajes consiguiéndose una reducción del tiempo de análisis y altas eficiencias. Se la considera una técnica intermedia entre la clásica electroforesis de zona (ZE) y la cromatografía (HPLC) líquida.Utiliza el principio de la electroforesis capilar en solución libre. La separación por CE es muy rápida, se realiza en menos de 5 minutos, con una reproducibilidad que muestran un coeficiente de variación (CVs) < 2%, muchos investigadores consideran que su sensibilidad es 10 veces mayor que la de la cromatografía líquida de alta performance. Se conocen varios sistemas de separación por ésta tecnología. La electroforesis capilar de zona(CZE); el isoelectroenfoque capilar (CIEF); la isotacoforesis capilar ( CITF) y la cromatografía micelar electrocinética (MECC). Desde 1990 el avance en ésta campo fue vertiginoso, ya que podemos incluir diagnósticos estudiando DNA, dficiencias enzimáticas, estudios de drogas de abuso en orina , estudios de esteroides y en cuando a el labortorio clínicoa, métodos para separasión de protéinas séricas, urinarias , variantes de hemoglobina, crioglobulinas, líquido céfalo raquídeo, proteinas reactantes de la fase aguda y muchas variantes más.