Potamotrygonidae constitui o único grupo recente de Chondrichthyes cujo habitat está restrito, exclusivamente, a águas continentais. Na planície de inundação do Alto rio Paraná, espécies desta família estabeleceram-se após o fechamento das comportas da usina hidrelétrica de Itaipu, a jusante. O objetivo deste trabalho foi, utilizando medidas corporais, identificar diferenças morfométricas entre indivíduos de Potamotrygon cf. motoro (Natterer in Müller & Henle, 1841) e Potamotrygon falkneri Castex & Maciel, 1963 capturadosnesta região, bem como estimar o tamanho com que machos destas espécies atingem a maturidade gonadal. Machos de P. falkneri e P. cf. motoro das populações avaliadas atingem a maturidade gonadal com largura do disco variando em torno de 26 cm e 23 cm, respectivamente. Na comparação das espécies, P. cf. motoro apresentou maior distânciaproporcional entre as narinas e maior comprimento proporcional da cauda e dos espiráculos. Identificou-se dimorfismo sexual secundário para P. falkneri, consistindo da presença de fileiras laterais de espinhos na cauda das fêmeas. Estudos futuros de morfologiafuncional e ecomorfologia poderão esclarecer o significado das diferenças morfométricas para o modo de vida destas espécies.Potamotrygonidae is the only extant chondrichthyan group restricted exclusively to freshwater. This family invaded the UpperParaná river system after the closing of Itaipu Dam. This study aimed to identify morphometric differences between Potamotrygon cf. motoro (Natterer in Müller & Henle, 1841) and Potamotrygon falkneri Castex & Maciel, 1963 sampled in that area, and estimate male size at gonadal maturation. P. falkneri and P. cf. motoro males reach gonadal maturation at 26 cm and 23 cm disc width, respectively. Comparing both species, P. cf. motoro presented larger tail, spiracles and distance between nostrils. Lateral small stings on tails ofP. falkneri females were observed as secondary sexual dimorphism. Further studies on functional morphology and ecomorphology may point the meaning of morphometric differences to these species’ ecological interactions.