La structure arborescente d’un cours traditionnel peut être complétée pour un cours en ligne par une structure de graphe lexical. Pour l’utilisateur, une couche lexique apparaît comme une plaque tournante qui connecte logiquement les principales notions du cours. Elle permet d’accéder non seulement aux notes rédigées, mais aussi à l’environnement étendu constituant le cours (articles de complément, activités expérimentales...). Pour l’implémentation, le lexique est codé comme une base de données, dont les entrées correspondent aux nœuds du graphe, et dont les différents champs contiennent les informations codant les liens hypertextes. Cette structure a été implémentée pour SMEL, un cours en ligne de statistique médicale.