Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/ CGIAR CGSpace (Consu...arrow_drop_down
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
Frontiers in Plant Science
Article . 2020 . Peer-reviewed
License: CC BY
Data sources: Crossref
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
Frontiers in Plant Science
Article
License: CC BY
Data sources: UnpayWall
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
PubMed Central
Other literature type . 2020
License: CC BY
Data sources: PubMed Central
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
Frontiers in Plant Science
Article . 2020
Data sources: DOAJ
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
NIBIO Brage
Article . 2020
Data sources: NIBIO Brage
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
https://dx.doi.org/10.60692/n0...
Other literature type . 2020
Data sources: Datacite
https://dx.doi.org/10.60692/zs...
Other literature type . 2020
Data sources: Datacite
versions View all 8 versions
addClaim

Potato Cyst Nematodes: A New Threat to Potato Production in East Africa

الديدان الخيطية في كيس البطاطس: تهديد جديد لإنتاج البطاطس في شرق أفريقيا
Authors: Harrison Mburu; Harrison Mburu; Harrison Mburu; Laura Cortada; Laura Cortada; Solveig Haukeland; Solveig Haukeland; +7 Authors
APC: 2,725.27 EUR

Potato Cyst Nematodes: A New Threat to Potato Production in East Africa

Abstract

Les nématodes à kystes de la pomme de terre (NPC), tels que Globodera rostochiensis et Globodera pallida, sont des ravageurs de la pomme de terre soumis à des restrictions de quarantaine qui entraînent des rendements importants et des pertes financières pour les agriculteurs. G. rostochiensis a été signalé pour la première fois dans la principale zone de culture de la pomme de terre du Kenya en 2015. Nous avons cherché à déterminer la diversité, la prévalence et la répartition des espèces de NPC à travers le pays en menant une enquête à l'échelle nationale entre 2016 et 2018, qui comprenait une évaluation de suivi plus ciblée dans trois principaux comtés producteurs de pommes de terre. Au total, 1 348 échantillons de sol ont été prélevés dans 20 comtés producteurs de pommes de terre. Des informations concernant les pratiques locales de culture de la pomme de terre, l'utilisation des cultivars de pomme de terre, leur diversité et leur disponibilité ont également été enregistrées. Les kystes de NPC ont été obtenus à partir de 968 échantillons (71,8 %) dans tous les comtés étudiés, le comté de Nyandarua enregistrant la plus forte incidence de NPC sur le terrain à 47,6 %. La majorité des populations de NPC, 99,9 %, ont été identifiées comme étant G. rostochiensis, tandis que G. pallida a été récupérée dans un seul champ, dans une population mixte avec G. rostochiensis. Des incohérences dans l'efficacité de l'amplification par PCR ont été observées pour G. rostochiensis en utilisant les amorces EPPO recommandées, par rapport à SES amorces AB28/TW81, indiquant que ce protocole ne peut pas être entièrement utilisé pour détecter efficacement la PCN. La densité des œufs dans le comté de Nyandarua variait entre 30,6 et 158,5 œufs viables/g de sol, avec une viabilité moyenne des œufs de 78,9 ± 2,8 % (min = 11,6 %, max = 99,9 %). Le cultivar de pomme de terre sensible aux PCN nommé Shangi était le plus préféré et utilisé par 65 % des agriculteurs en raison de sa dormance et de son temps de cuisson plus courts, tandis que les cultivars importés (Destiny, Jelly, Manitou et Markies) résistants à G. rostochiensis étaient utilisés par 7,5 % des agriculteurs en raison de l'indisponibilité et/ou de l'accès limité aux semences. Ainsi, la plupart des agriculteurs préféraient utiliser leurs propres semences conservées à la ferme plutôt que d'acheter des semences certifiées. Établir la distribution et la prévalence des polychloronaphtalènes et élucider les pratiques agricoles locales qui pourraient favoriser la propagation des polychloronaphtalènes est un précurseur nécessaire à la mise en œuvre de toute stratégie de confinement ou de gestion dans le pays et, en fin de compte, dans la région.

Los nematodos del quiste de la papa (PCN), como Globodera rostochiensis y Globodera pallida, son plagas restringidas de cuarentena de la papa que causan grandes pérdidas financieras y de rendimiento a los agricultores. G. rostochiensis se informó por primera vez en la zona clave de cultivo de patatas de Kenia en 2015. Buscamos determinar la diversidad, prevalencia y distribución de las especies de PCN en todo el país mediante la realización de una encuesta a nivel nacional entre 2016 y 2018, que incluyó una evaluación de seguimiento más centrada en tres condados clave de cultivo de papa. Se recolectaron un total de 1.348 muestras de suelo de 20 condados productores de papa. También se registró información sobre las prácticas locales de cultivo de papa, el uso del cultivar de papa, su diversidad y disponibilidad. Los quistes de PCN se obtuvieron de 968 muestras (71.8%) en todos los condados encuestados, y el condado de Nyandarua registró la mayor incidencia de campo de PCN con un 47.6%. La mayoría de las poblaciones de PCN, el 99,9%, se identificaron como G. rostochiensis, mientras que G. pallida se recuperó de un solo campo, en una población mixta con G. rostochiensis. Se observaron inconsistencias en la eficiencia de amplificación por PCR para G. rostochiensis utilizando los cebadores EPPO recomendados, en comparación con SUS cebadores AB28/TW81, lo que indica que no se puede confiar completamente en este protocolo para detectar eficazmente PCN. La densidad de huevos en el condado de Nyandarua varió entre 30.6 y 158.5 huevos viables/g de suelo, con una viabilidad promedio de huevos de 78.9 ± 2.8% (min = 11.6%, max = 99.9%). El cultivar de papa susceptible a PCN llamado Shangi fue el más preferido y utilizado por el 65% de los agricultores debido a su latencia y tiempo de cocción más cortos, mientras que los cultivares importados (Destiny, Jelly, Manitou y Markies) con resistencia a G. rostochiensis fueron utilizados por el 7,5% de los agricultores debido a la falta de disponibilidad y/o acceso limitado a las semillas. Por lo tanto, la mayoría de los agricultores prefirieron usar sus propias semillas guardadas en la granja en lugar de comprar semillas certificadas. Establecer la distribución y prevalencia de PCN y dilucidar las prácticas agrícolas locales que podrían promover la propagación de PCN es un precursor necesario para la implementación de cualquier estrategia de contención o gestión en el país y, en última instancia, en toda la región.

Potato cyst nematodes (PCN), such as Globodera rostochiensis and Globodera pallida, are quarantine restricted pests of potato causing major yield and financial losses to farmers. G. rostochiensis was first reported from Kenya's key potato growing area in 2015. We sought to determine the diversity, prevalence and distribution of PCN species across the country by conducting a country-wide survey between 2016 and 2018, which included a more focused, follow-up assessment in three key potato growing counties. A total of 1,348 soil samples were collected from 20 potato growing counties. Information regarding local potato farming practices, potato cultivar use, their diversity and availability was also recorded. PCN cysts were obtained from 968 samples (71.8%) in all the counties surveyed, with Nyandarua County recording the highest PCN field-incidence at 47.6%. The majority of PCN populations, 99.9%, were identified as G. rostochiensis, while G. pallida was recovered from just one field, in a mixed population with G. rostochiensis. Inconsistencies in PCR amplification efficiency was observed for G. rostochiensis using the recommended EPPO primers, compared with ITS primers AB28/TW81, indicating that this protocol cannot be entirely relied upon to effectively detect PCN. Egg density in Nyandarua County varied between 30.6 and 158.5 viable eggs/g soil, with an average egg viability of 78.9 ± 2.8% (min = 11.6%, max = 99.9%). The PCN-susceptible potato cultivar named Shangi was the most preferred and used by 65% of farmers due to its shorter dormancy and cooking time, while imported cultivars (Destiny, Jelly, Manitou, and Markies) with resistance to G. rostochiensis were used by 7.5% of farmers due to unavailability and/or limited access to seeds. Thus, most farmers preferred using their own farm-saved seeds as opposed to purchasing certified seeds. Establishing the distribution and prevalence of PCN and elucidating the local farming practices that could promote the spread of PCN is a necessary precursor to the implementation of any containment or management strategy in the country and ultimately across the region.

الديدان الخيطية في كيس البطاطس (PCN)، مثل Globodera rostochiensis و Globodera pallida، هي آفات مقيدة في الحجر الصحي للبطاطس تسبب غلة كبيرة وخسائر مالية للمزارعين. تم الإبلاغ عن G. rostochiensis لأول مرة من منطقة زراعة البطاطس الرئيسية في كينيا في عام 2015. سعينا إلى تحديد تنوع وانتشار وتوزيع أنواع النفثالينات المتعددة الكلور في جميع أنحاء البلاد من خلال إجراء مسح على مستوى البلاد بين عامي 2016 و 2018، والذي تضمن تقييم متابعة أكثر تركيزًا في ثلاث مقاطعات رئيسية لزراعة البطاطس. تم جمع ما مجموعه 1348 عينة تربة من 20 مقاطعة لزراعة البطاطس. كما تم تسجيل المعلومات المتعلقة بممارسات زراعة البطاطس المحلية، واستخدام أصناف البطاطس، وتنوعها وتوافرها. تم الحصول على أكياس النفثالينات المتعددة الكلور من 968 عينة (71.8 ٪) في جميع المقاطعات التي شملتها الدراسة الاستقصائية، حيث سجلت مقاطعة نيانداروا أعلى نسبة إصابة ميدانية بالنفثالينات المتعددة الكلور بنسبة 47.6 ٪. تم تحديد غالبية مجموعات النفثالينات المتعددة الكلور، 99.9 ٪، على أنها G. rostochiensis، في حين تم استرداد G. pallida من حقل واحد فقط، في مجموعة مختلطة مع G. rostochiensis. لوحظ وجود تناقضات في كفاءة تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل لـ G. rostochiensis باستخدام المواد التمهيدية EPPO الموصى بها، مقارنة بالمواد التمهيدية AB28/TW81، مما يشير إلى أنه لا يمكن الاعتماد على هذا البروتوكول بالكامل للكشف الفعال عن النفثالينات المتعددة الكلور. تفاوتت كثافة البيض في مقاطعة نيانداروا بين 30.6 و 158.5 بيضة قابلة للحياة/جم من التربة، بمتوسط صلاحية البيض 78.9 ± 2.8 ٪ (الحد الأدنى = 11.6 ٪، والحد الأقصى = 99.9 ٪). كان صنف البطاطس الحساس لـ PCN المسمى Shangi هو الأكثر تفضيلاً واستخدامًا من قبل 65 ٪ من المزارعين بسبب قصر فترة السكون ووقت الطهي، بينما تم استخدام الأصناف المستوردة (Destiny و Jelly و Manitou و Markies) مع مقاومة G. rostochiensis من قبل 7.5 ٪ من المزارعين بسبب عدم توفر و/أو محدودية الوصول إلى البذور. وبالتالي، فضل معظم المزارعين استخدام بذورهم المحفوظة في المزارع بدلاً من شراء بذور معتمدة. إن تحديد توزيع وانتشار النفثالينات المتعددة الكلور وتوضيح الممارسات الزراعية المحلية التي يمكن أن تعزز انتشار النفثالينات المتعددة الكلور هو مقدمة ضرورية لتنفيذ أي استراتيجية احتواء أو إدارة في البلاد وفي نهاية المطاف في جميع أنحاء المنطقة.

Countries
Norway, France, Belgium
Keywords

yield losses, SOLANUM-TUBEROSUM, Genomic and Epidemiological Studies of Phytophthora Pathogens, Plant Science, seeds, Biochemistry, Gene, SB1-1110, Agricultural and Biological Sciences, potato seed systems, Sociology, smallholder farmers, Solanaceae, Nematode, Ecology, Life Sciences, smallholders, FOS: Sociology, Quarantine, cv, Potato, STORAGE, EPPO, globodera pallida, globodera rostochiensis, Formation and Health Effects of Acrylamide in Food, Population, farmers, Horticulture, potatoes, Globodera rostochiensis, GLOBODERA-ROSTOCHIENSIS, Biology, Demography, Biology and Life Sciences, Plant culture, Globodera pallida, Shangi, Kenya, Agronomy, Plant-Parasitic Nematodes in Molecular Plant Pathology, kenya, Potato cyst nematode, FOS: Biological sciences, nematodes, Cultivar, pests, Food Science

  • BIP!
    Impact byBIP!
    selected citations
    These citations are derived from selected sources.
    This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    58
    popularity
    This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
    Top 1%
    influence
    This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    Top 10%
    impulse
    This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
    Top 1%
Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
selected citations
These citations are derived from selected sources.
This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Citations provided by BIP!
popularity
This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
BIP!Popularity provided by BIP!
influence
This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Influence provided by BIP!
impulse
This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
BIP!Impulse provided by BIP!
58
Top 1%
Top 10%
Top 1%
Green
gold