Antecedentes: Existe poca evidencia sobre el papel de los polimorfismos de CETP sobre la obesidad o la diabetes mellitus. Objetivos: Evaluar la asociación del polimorfismo (rs1800777) del gen CETP sobre parámetros antropométricos, perfil lipídico y adipocitoquinas en pacientes obesos con diabetes mellitus. Diseño: Un total de 229 obesos con diabetes mellitus tipo 2 fueron reclutados. Una impedancia bioeléctrica, la presión arterial, ingesta dietética, ejercicio y bioquímica fueron analizados. Resultados: Un total de 217 pacientes (94,8%) presentaron el genotipo GG y 12 pacientes GA (5,2%) (no se detectó el genotipo AA). El peso (delta: 14,4±2,1 kg, p = 0,01), índice de masa corporal (delta: 2,2±1,1 kg/m2, p = 0,01), masa grasa (delta: 11,2±3,1 kg, p = 0,02), circunferencia de la cintura (delta: 3,9±2,0 cm, p = 0,02), índice cintura-cadera (delta: 0,04 ± 0,02 cm; p = 0,01), triglicéridos (delta: 48,6+9,1 mg / dl, p = 0,03) y leptina (delta: 58,6+15,9 mg / dl, p = 0,02) fueron superiores en los pacientes con el alelo A que en los no portadores del alelo A. El HDL-colesterol fue menor en los portadores de alelo A que los no portadores (delta: 5,6+1,1 mg / dl, p = 0,03). Conclusión: Nuestros resultados muestran una asociación del polimorfismo en posición +82 del gen CETP sobre los niveles de HDL colesterol, triglicéridos y parámetros de adiposidad en pacientes obesos con diabetes mellitus tipo 2.