publication . Master thesis . 2016

Estudo do papel do gene Rv1358 no estabelecimento e maturação dos biofilmes formados por bactérias do complexo Mycobacterium Tuberculosis

Vaz, Marta Helena Melo de Campos e Cunha;
Open Access Portuguese
  • Published: 01 Jan 2016
  • Country: Portugal
Abstract
Tese de mestrado, Biologia Molecular e Genética, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2016 A tuberculose é uma doença infeciosa de etiologia bacteriana, com uma incidência anual média superior a 9 milhões de casos e tendo sido associada à morte de 1.5 milhões de indivíduos só em 2014. Dentro do género Mycobacterium, o complexo Mycobacterium tuberculosis (MTC) engloba várias espécies patogénicas, fenotipica e genotipicamente relacionadas, nomeadamente Mycobacterium tuberculosis, o principal agente etiológico da tuberculose humana, e M. bovis, o agente da tuberculose bovina. A interação entre M. tuberculosis e os macrófagos é um processo complexo que det...
Subjects
free text keywords: Mycobacterium bovis, Tuberculose, Biofilmes, Stresse oxidativo e nitrosativo, Rv1358, Departamento de Biologia Vegetal
Related Organizations
Funded by
FCT| PTDC/CVT/117794/2010
Project
PTDC/CVT/117794/2010
MyPATH- Insights into Mycobacterium tuberculosis complex PATHogenesis: assessing the benefit of confinement-induced biofilm strategies by comparative genomics
  • Funder: Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P. (FCT)
  • Project Code: 117794
  • Funding stream: 3599-PPCDT
88 references, page 1 of 6

3.3 Manutenção das culturas, condições de crescimento em meio sólido e preparação de pré- inóculos para o crescimento em meio líquido ...................................................................................... 10 3.6 Ensaios para avaliação do efeito da adição de stresse na formação de biofilmes em micobactérias ........................................................................................................................................ 11 3.9.2 Ligação entre o cosmídeo pYUB854- Rv1358 e o fagemídeo phAE 159, transfeção e eletrotransformação de culturas de E. coli e de M. smegmatis ........................................................... 14 4.1 Enquadramento do gene Rv1358 no genoma dos membros do MTC, funções biológicas atribuídas à proteína Rv1358 e presumíveis interações ....................................................................... 15 4.2.1 Análise comparativa da sequência nucleotídica do gene Rv1358 nos genomas de bactérias do MTC….. ............................................................................................................................................. 16 4.2.2 Análise de polimorfismos no gene Rv1358 em estirpes clínicas de M. tuberculosis que circulam a nível mundial........................................................................................................................ 18 4.2.3 Verificação da existência de polimorfismos no gene Rv1358 em isolados de campo de M.

[4] Organização Mundial de Saúde, “Global tuberculosis report 2015,” Global tuberculosis report, p. 18-22, 2015.

[5] V. Naranjo, C. Gortazar, J. Vicente e J. d. l. Fuente, “Evidence of the role of European wild boar as a reservoir of Mycobacterium tuberculosis complex,” Veterinary Microbiology, vol. 127, p. 1-9, 2008.

[6] T. C. Thacker, M. V. Palmer e W. R. Waters, “Associations between cytokine gene expression and pathology in Mycobacterium bovis infected cattle,” Veterinary Immunology and Immunopathology, vol. 199, p. 204-213, 2007.

[7] I. Schiller, B. Oesch, H. M. Vordermeier, M. V. Palmer, B. N. Harris, K. A. Orloski, B. M. Buddle, T. C. Thacker, K. P. Lyashchenko e W. R. Waters, “Bovine Tuberculosis: A Review of Current and Emerging Diagnostic Techniques in View of their Relevance for Disease Control and Eradication,” Transboundary and Emerging Diseases, vol. 57, p. 205-220, 2010.

[8] B. Saviola e W. Bishai, “The Genus Mycobacterium-Medical,” em Prokaryotes, vol. 3, 2006, p. 919-933.

[9] M. M. Pádua, Patologia Clínica para técnicos-Bacteriologia, Lusociência, 2009, p. 275-296.

[10] J. P. Euzéby, “List of prokaryotic names with standing in nomenclature,” 1997. [Online]. Available: http://www.bacterio.net/mycobacterium.html . [Acedido em 30 Dezembro 2015]. [OpenAIRE]

[11] R. Brosch, S. V. G. M. Marmiesse, P. Brodin, C. Buchriese, K. Eiglmeier, T. Garnier, C. Gutierrez, G. Hewinson, K. Kremer, L. M. Parson, S. S. A. S. Pym, D. v. Soolingen e S. T. Cole, “A new evolutionary scenario for the Mycobacterium tuberculosis complex,” PNAS, vol. 99, p. 3684-3689, 2002.

[12] J. Liu, C. E. Barry, G. S. Besra e H. Nikaido, “Mycolic Acid Structure Determines the Fluidity of the Mycobacterial Cell Wall,” The Journal of Biological Chemistry, vol. 271, p. 29545-29551, 1996. [OpenAIRE]

[13] A. Bhatt, V. Molle, G. Besra, W. R. Jacobs e L. Kremer, “The Mycobacterium tuberculosis FAS-II condensing enzymes: their role in mycolic acid biosynthesis, acid-fastness, pathogenesis and in future drug development,” Molecular Microbiology, p. 1442-1454, 2007.

[14] I. Vergne, G. Martine e N. Jérôme, “Manipulation of the endocytic pathway and phagocyte functions by Mycobacterium tuberculosis lipoarabinomannan,” Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, vol. 4, p. 1-9, 2015.

[15] M. Skoric, E. Shitaye, R. Halouzka, P. Fictum, I. Trcka, M. Heroldova, E. Tkadlec e I. Pavlik, “Tuberculous and tuberculoid lesions in free living small terrestrial mammals and the risk of infection to humans and animals: a review,” Veterinarni Medicina, vol. 52, p. 144-161, 2007.

[16] P. R. Marri, J. P. Bannantine e G. B. Golding, “Comparative genomics of metabolic pathways in Mycobacterium species:gene duplication,gene decayand lateral gene transfer,” Federation of European Microbiological Societies, vol. 30, p. 906-925, 2006. [OpenAIRE]

[17] K. M. Derbyshire e T. A. Gray, “Distributive Conjugal Transfer: New Insights into Horizontal Gene Transfer and Genetic Exchange in Mycobacteria,” American Society for Microbiology, vol. 2, p. MGM2-0022-2013, 2014.

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Tese de mestrado, Biologia Molecular e Genética, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2016 A tuberculose é uma doença infeciosa de etiologia bacteriana, com uma incidência anual média superior a 9 milhões de casos e tendo sido associada à morte de 1.5 milhões de indivíduos só em 2014. Dentro do género Mycobacterium, o complexo Mycobacterium tuberculosis (MTC) engloba várias espécies patogénicas, fenotipica e genotipicamente relacionadas, nomeadamente Mycobacterium tuberculosis, o principal agente etiológico da tuberculose humana, e M. bovis, o agente da tuberculose bovina. A interação entre M. tuberculosis e os macrófagos é um processo complexo que det...
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free text keywords: Mycobacterium bovis, Tuberculose, Biofilmes, Stresse oxidativo e nitrosativo, Rv1358, Departamento de Biologia Vegetal
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FCT| PTDC/CVT/117794/2010
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PTDC/CVT/117794/2010
MyPATH- Insights into Mycobacterium tuberculosis complex PATHogenesis: assessing the benefit of confinement-induced biofilm strategies by comparative genomics
  • Funder: Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P. (FCT)
  • Project Code: 117794
  • Funding stream: 3599-PPCDT
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3.3 Manutenção das culturas, condições de crescimento em meio sólido e preparação de pré- inóculos para o crescimento em meio líquido ...................................................................................... 10 3.6 Ensaios para avaliação do efeito da adição de stresse na formação de biofilmes em micobactérias ........................................................................................................................................ 11 3.9.2 Ligação entre o cosmídeo pYUB854- Rv1358 e o fagemídeo phAE 159, transfeção e eletrotransformação de culturas de E. coli e de M. smegmatis ........................................................... 14 4.1 Enquadramento do gene Rv1358 no genoma dos membros do MTC, funções biológicas atribuídas à proteína Rv1358 e presumíveis interações ....................................................................... 15 4.2.1 Análise comparativa da sequência nucleotídica do gene Rv1358 nos genomas de bactérias do MTC….. ............................................................................................................................................. 16 4.2.2 Análise de polimorfismos no gene Rv1358 em estirpes clínicas de M. tuberculosis que circulam a nível mundial........................................................................................................................ 18 4.2.3 Verificação da existência de polimorfismos no gene Rv1358 em isolados de campo de M.

[4] Organização Mundial de Saúde, “Global tuberculosis report 2015,” Global tuberculosis report, p. 18-22, 2015.

[5] V. Naranjo, C. Gortazar, J. Vicente e J. d. l. Fuente, “Evidence of the role of European wild boar as a reservoir of Mycobacterium tuberculosis complex,” Veterinary Microbiology, vol. 127, p. 1-9, 2008.

[6] T. C. Thacker, M. V. Palmer e W. R. Waters, “Associations between cytokine gene expression and pathology in Mycobacterium bovis infected cattle,” Veterinary Immunology and Immunopathology, vol. 199, p. 204-213, 2007.

[7] I. Schiller, B. Oesch, H. M. Vordermeier, M. V. Palmer, B. N. Harris, K. A. Orloski, B. M. Buddle, T. C. Thacker, K. P. Lyashchenko e W. R. Waters, “Bovine Tuberculosis: A Review of Current and Emerging Diagnostic Techniques in View of their Relevance for Disease Control and Eradication,” Transboundary and Emerging Diseases, vol. 57, p. 205-220, 2010.

[8] B. Saviola e W. Bishai, “The Genus Mycobacterium-Medical,” em Prokaryotes, vol. 3, 2006, p. 919-933.

[9] M. M. Pádua, Patologia Clínica para técnicos-Bacteriologia, Lusociência, 2009, p. 275-296.

[10] J. P. Euzéby, “List of prokaryotic names with standing in nomenclature,” 1997. [Online]. Available: http://www.bacterio.net/mycobacterium.html . [Acedido em 30 Dezembro 2015]. [OpenAIRE]

[11] R. Brosch, S. V. G. M. Marmiesse, P. Brodin, C. Buchriese, K. Eiglmeier, T. Garnier, C. Gutierrez, G. Hewinson, K. Kremer, L. M. Parson, S. S. A. S. Pym, D. v. Soolingen e S. T. Cole, “A new evolutionary scenario for the Mycobacterium tuberculosis complex,” PNAS, vol. 99, p. 3684-3689, 2002.

[12] J. Liu, C. E. Barry, G. S. Besra e H. Nikaido, “Mycolic Acid Structure Determines the Fluidity of the Mycobacterial Cell Wall,” The Journal of Biological Chemistry, vol. 271, p. 29545-29551, 1996. [OpenAIRE]

[13] A. Bhatt, V. Molle, G. Besra, W. R. Jacobs e L. Kremer, “The Mycobacterium tuberculosis FAS-II condensing enzymes: their role in mycolic acid biosynthesis, acid-fastness, pathogenesis and in future drug development,” Molecular Microbiology, p. 1442-1454, 2007.

[14] I. Vergne, G. Martine e N. Jérôme, “Manipulation of the endocytic pathway and phagocyte functions by Mycobacterium tuberculosis lipoarabinomannan,” Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, vol. 4, p. 1-9, 2015.

[15] M. Skoric, E. Shitaye, R. Halouzka, P. Fictum, I. Trcka, M. Heroldova, E. Tkadlec e I. Pavlik, “Tuberculous and tuberculoid lesions in free living small terrestrial mammals and the risk of infection to humans and animals: a review,” Veterinarni Medicina, vol. 52, p. 144-161, 2007.

[16] P. R. Marri, J. P. Bannantine e G. B. Golding, “Comparative genomics of metabolic pathways in Mycobacterium species:gene duplication,gene decayand lateral gene transfer,” Federation of European Microbiological Societies, vol. 30, p. 906-925, 2006. [OpenAIRE]

[17] K. M. Derbyshire e T. A. Gray, “Distributive Conjugal Transfer: New Insights into Horizontal Gene Transfer and Genetic Exchange in Mycobacteria,” American Society for Microbiology, vol. 2, p. MGM2-0022-2013, 2014.

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