Nuclear DNA content in some plant kinds used as an external standard in flow cytometry

Article Russian OPEN
Skaptsov, M. V. ; Smirnov, S. V. ; Kutsev, M. G. (2015)
  • Publisher: Altai State University
  • Journal: Turczaninowia (issn: 1560-7267, eissn: 1560-7259)
  • Related identifiers: doi: 10.14258/turczaninowia.17.3.8
  • Subject: Botany | QK1-989

Целью исследований стало опреде- ление содержания ДНК и размера генома некоторых сортов культурных растений для использования их в последующем в качестве внешнего стандарта в проточной цитометрии растений. Основной задачей являлся поиск широко распространенных сортов культурных растений, позволяющих исследовать большинство растительных объектов с содержанием ДНК в диапазоне от 0,1 до 60 пг. Кроме того, в работе были проанализированы и сопоставлены данные из международных баз данных с фактическим содержанием ДНК отечественных сортов растений. Также приведены рекомендации для оптимизации методики проведения эксперимента и интерпретации данных. В результате работы установлено несколько сортов растений, наиболее удобных для использования в качестве внешнего стандарта. Сорта родов L<em>epidium, Sinapis, Petroselinum, Pisum, Lathyrus</em> и <em>Vicia</em> отличаются высокими показателями изоляции ядер, большим количеством изолированных ядер, а также низким количеством разрушенных ядер, а соответственно, низким уровнем фоновой флюоресценции, что немаловажно для проведения эксперимента.
  • References (17)
    17 references, page 1 of 2

    Bennett M.D., Leitch I.J. Plant DNA C-values database (release 6.0, Dec. 2012) [Electronic resource] // Royal botanical garden KEW [Official website]. URL: http://www.kew.org/cvalues/ (accessed: 12 V 2014)

    Doležel J., Bartoš J., Voglmayr H., Greilhuber J. Nuclear dna content and genome size of trout and human // Cytometry, 2003. - Vol. 51. - P. 127-128. DOI: 10.1002/cyto.a.10013

    Doležel J., Doleželova M., Novak F.J. Flow cytometric estimation of nuclear DNA amount in diploid bananas (Musa acuminata and M. balbisiana) // Biologia Plantarum, 1994. - Vol. 36, No. 351 - P. 357. DOI: 10.1007/ BF02920930

    Doležel J., Greilhuber J., Lucretti S., Meister A., Lysak M., Nardi L., Obermayer R. Plant genome size estimation by flow cytometry: inter-laboratory comparison // Annals of Botany, 1998. - Vol. 82. - Suppl. A. - P. 17-26.

    Doležel J., Greilhuber J., Suda J. Estimation of nuclear DNA content in plants using flow cytometry // Nature Protoc., 2007. - Vol. 2. - P. 2233-2244. DOI: 10.1038/nprot.2007.310

    Doležel J., Sgorbati S., Lucretti S. Comparison of three DNA fluorochromes for flow cytometric estimation of nuclear DNA content in plants // Physiologia Plantarum, 1992. - Vol. 85. - P. 625-631. DOI: 10.1111/j.1399-3054.1992. tb04764.x

    Greilhuber J., Ebert I. Genome size variation in Pisum sativum // Genome, 1994. - Vol. 37, No. 4. - P. 646-655. DOI: 10.1139/g94-092

    Jiao Y.,Wickett N., Ayyampalayam S., Chanderbali A., Landherr L., Ralph P., Tomsho L., Hu Y., Liang H., Soltis P., Soltis D., Clifton S., Schlarbaum S., Schuster S., Ma H., Leebens-Mack J., dePamphilis C. Ancestral polyploidy in seed plants and angiosperms // Nature, 2011. - Vol. 473. - P. 97-100. DOI: 10.1038/nature09916

    Kubešová M., Moravcová L., Suda J., Jarošík V., Pyšek P. Naturalized plants have smaller genomes than their non-invading relatives: a flow cytometric analysis of the Czech alien flora // Preslia, 2010. - Vol. 82. - P. 81-96.

    Marie D, Brown S.C. A cytometric exercise in plant DNA histograms, with 2C values for 70 species // Biology of the Cell, 1993. - Vol. 78. - P. 41-51. DOI: 10.1016/0248-4900(93)90113-S

  • Metrics
    No metrics available
Share - Bookmark