publication . Article . 2016

Проблемы стандартизации в проточной цитометрии растений

Skaptsov, M. V.; Smirnov, S. V.; Kutsev, M. G.; Shmakov, A. I.;
Open Access Russian
  • Published: 23 Sep 2016 Journal: Turczaninowia (issn: 1560-7267, eissn: 1560-7259, Copyright policy)
  • Publisher: Altai State University
Abstract
В сообщении обсуждаются проблемы, возникающие при установлении стандартов в исследованиях по проточной цитометрии. Авторами предлагается к использованию ряд новых видов оранжерейных растений в качестве стандартов. Приводятся данные об относительном содержании их ДНК. Установлено, что для Ficus benjamina 2С = 1,07 пг, Euryops chrysanthemoides 2С=2,70 пг, Schefflera octophylla 2С = 4,65 пг, × Fatshedera lizei 2С = 6,34 пг, Davallia mariesii 2С = 15,37 пг, Zamioculcas zamiifolia 2С = 48,35 пг.

Animal genome size database (2016) URL: http://www.genomesize.com/result_species.php?id=906 (Accessed 02.09.2016).

Doležel, J., Bartoš, J. (2005) Plant DNA flow cytometry and estimation of nuclear genome size. Ann. Bot. 95(1): 99-110. DOI: 10.1093/aob/mci005

Doležel, J., Bartoš, J., Voglmayr, H., Greilhuber, J. (2003) Nuclear DNA content and genome size of trout and human. Cytometry Part A 51(2): 127-128. DOI: 10.1002/cyto.a.10013

Doležel, J., Doleželova, M., Novak, F. J. (1994) Flow cytometric estimation of nuclear DNA amount in diploid bananas (Musa acuminata and M. balbisiana). Biol. Plant. 36: 351 - 357. DOI: 10.1007/BF02920930

Doležel, J., Greilhuber, J., Lucretti, S., Meister, A., Lysak, M., Nardi, L., Obermayer, R. (1998) Plant genome size estimation by flow cytometry: inter-laboratory comparison. Ann. Bot. 82: 17-26.

Doležel, J., Sgorbati, S., Lucretti, S. (1992) Comparison of three DNA fluorochromes for flow cytometric estimation of nuclear DNA content in plants. Physiol. Plant. 85: 625-631. DOI: 10.1111/j.1399-3054.1992.tb04764.x

Johnston, J. S., Bennett, M. D., Rayburn, A. L., Galbraith, D. W., Price, H. J. (1999) Reference standards for determination of DNA content of plant nuclei. Am. J. Bot. 86(5): 609-613.

Kubešová, M., Moravcová, L., Suda, J., Jarošík, V., Pyšek, P. (2010) Naturalized plants have smaller genomes than their non-invading relatives: a flow cytometric analysis of the Czech alien flora. Preslia 82: 81-96.

Initial sequencing and analysis of the human genome. International Human Genome Sequencing Consortium (2001) Nature 409: 860-921. DOI: 10.1038/35057062

Ojima, Y., Yamamoto, K. (1990) Cellular DNA contents of fishes determined by flow cytometry. La Kromosomo 57: 1871-1888.

Pedersen, R. A. (1971) DNA content, ribosomal gene multiplicity, and cell size in fish. J. Exp. Zoology 177: 65-79. DOI: 10.1002/jez.1401770108

Skaptsov, M. V., Smirnov, S. V., Kutsev, M. G. (2014) Nuclear DNA content in some plant kinds used as an external standard in flow cytometry. Turczaninowia 17(3): 72-78 [In Russian]. (Скапцов М. В., Смирнов С. В., Куцев М. Г. Содержание ядерной ДНК в некоторых сортах растений, используемых в качестве внешних стандартов в проточной цитометрии // Turczaninowia, 2014. Т. 17, вып. 3. С. 72-78). DOI: 10.14258/turczaninowia.17.3.8

Tiersch, T. R., Chandler, R. W., Wachtel, S. S. M., Ellias, S. (1989) Reference standards for flow cytometry and application in comparative studies of nuclear DNA content. Cytometry 10: 706-710. DOI: 10.1002/cyto.990100606

Abstract
В сообщении обсуждаются проблемы, возникающие при установлении стандартов в исследованиях по проточной цитометрии. Авторами предлагается к использованию ряд новых видов оранжерейных растений в качестве стандартов. Приводятся данные об относительном содержании их ДНК. Установлено, что для Ficus benjamina 2С = 1,07 пг, Euryops chrysanthemoides 2С=2,70 пг, Schefflera octophylla 2С = 4,65 пг, × Fatshedera lizei 2С = 6,34 пг, Davallia mariesii 2С = 15,37 пг, Zamioculcas zamiifolia 2С = 48,35 пг.

Animal genome size database (2016) URL: http://www.genomesize.com/result_species.php?id=906 (Accessed 02.09.2016).

Doležel, J., Bartoš, J. (2005) Plant DNA flow cytometry and estimation of nuclear genome size. Ann. Bot. 95(1): 99-110. DOI: 10.1093/aob/mci005

Doležel, J., Bartoš, J., Voglmayr, H., Greilhuber, J. (2003) Nuclear DNA content and genome size of trout and human. Cytometry Part A 51(2): 127-128. DOI: 10.1002/cyto.a.10013

Doležel, J., Doleželova, M., Novak, F. J. (1994) Flow cytometric estimation of nuclear DNA amount in diploid bananas (Musa acuminata and M. balbisiana). Biol. Plant. 36: 351 - 357. DOI: 10.1007/BF02920930

Doležel, J., Greilhuber, J., Lucretti, S., Meister, A., Lysak, M., Nardi, L., Obermayer, R. (1998) Plant genome size estimation by flow cytometry: inter-laboratory comparison. Ann. Bot. 82: 17-26.

Doležel, J., Sgorbati, S., Lucretti, S. (1992) Comparison of three DNA fluorochromes for flow cytometric estimation of nuclear DNA content in plants. Physiol. Plant. 85: 625-631. DOI: 10.1111/j.1399-3054.1992.tb04764.x

Johnston, J. S., Bennett, M. D., Rayburn, A. L., Galbraith, D. W., Price, H. J. (1999) Reference standards for determination of DNA content of plant nuclei. Am. J. Bot. 86(5): 609-613.

Kubešová, M., Moravcová, L., Suda, J., Jarošík, V., Pyšek, P. (2010) Naturalized plants have smaller genomes than their non-invading relatives: a flow cytometric analysis of the Czech alien flora. Preslia 82: 81-96.

Initial sequencing and analysis of the human genome. International Human Genome Sequencing Consortium (2001) Nature 409: 860-921. DOI: 10.1038/35057062

Ojima, Y., Yamamoto, K. (1990) Cellular DNA contents of fishes determined by flow cytometry. La Kromosomo 57: 1871-1888.

Pedersen, R. A. (1971) DNA content, ribosomal gene multiplicity, and cell size in fish. J. Exp. Zoology 177: 65-79. DOI: 10.1002/jez.1401770108

Skaptsov, M. V., Smirnov, S. V., Kutsev, M. G. (2014) Nuclear DNA content in some plant kinds used as an external standard in flow cytometry. Turczaninowia 17(3): 72-78 [In Russian]. (Скапцов М. В., Смирнов С. В., Куцев М. Г. Содержание ядерной ДНК в некоторых сортах растений, используемых в качестве внешних стандартов в проточной цитометрии // Turczaninowia, 2014. Т. 17, вып. 3. С. 72-78). DOI: 10.14258/turczaninowia.17.3.8

Tiersch, T. R., Chandler, R. W., Wachtel, S. S. M., Ellias, S. (1989) Reference standards for flow cytometry and application in comparative studies of nuclear DNA content. Cytometry 10: 706-710. DOI: 10.1002/cyto.990100606

Powered by OpenAIRE Open Research Graph
Any information missing or wrong?Report an Issue