CNC.IBILI is a new unit that results from the fusion of two biomedical research institutes of excellence in Portugal - CNC and IBILI - and incorporates the largest critical mass of biomedical investigators in the Center region of Portugal. Deeply rooted at the University of Coimbra, CNC.IBILI joins together researchers from the Faculties of Medicine, Pharmacy, Science and Technology, and the Institute for Interdisciplinary Research around common objectives of biomedical research. The synergies created by the fusion of CNC and IBILI will generate the opportunity for novel achievements in neurosciences, vision, aging, brain diseases and advanced therapies. CNC.IBILI is composed of 21 groups supported by strong Core CVs of researchers integrated in prestigious international networks. These groups are organized in three Thematic Strands. The Neuroscience, Vision and Brain Diseases Thematic Strand comprises researchers with a comprehensive know-how, ranging from molecular studies to human brain imaging. The Strand is focused on understanding brain and visual function at the molecular and cellular levels as well as on identifying brain circuits implicated in behavior and in brain diseases. We propose to integrate evaluation of molecular and phenotypic parameters with state-of-the-art in vivo physiological recordings and imaging of the brain, in a multilevel approach to address fundamental questions on brain function and its impairment. The groups in this strand aim to pinpoint mechanisms of vision and brain diseases, focusing particularly in defects on synaptic processes and on brain metabolism, in order to design effective therapies. The Metabolism, Aging and Disease Strand links cellular dysfunction (namely mitochondrial activity, oxidative stress and protein folding), with metabolism-based changes in diabetes, neurodegenerative and aging-related disorders, in order to both unveil basic mechanisms that may suggest possible molecular and cellular therapeutic targets for these conditions, and provide novel non-invasive diagnostic strategies using metabolite tracers. The Stem-cell-based and Molecular Therapies Strand aims at investigating translational advanced therapies for neurodegenerative, cardiovascular and infectious diseases, as well as cancer. For this we take advantage of stem cells and of molecular therapy strategies aiming at i) establishment of disease models and study of molecular mechanisms of disease, ii) investigation of new advanced nucleic acid-based therapies with viral and non-viral vectors approaches, iii) establishment of stem cell-based therapies for the treatment of ischemic diseases, iv) development of novel methods for cell reprogramming and stem cell modulation/differentiation and v) creation of stem cell–based assays and in silico approaches for drug screening. CNC.IBILI is uniquely positioned in terms of transforming excellent basic research to both translational interventions and increased economic value. The close connection to the Coimbra University Hospitals Health System (CHUC), one of the largest in Portugal, provides access to clinical know-how, patient samples, and patients themselves, ensuring the possibility of both CNC.IBILI pioneered initiatives, and the participation in international consortia. Collaborations with AIBILI allow CNC.IBILI to implement clinical trials and take the research results into clinical practice. On the other hand, collaboration with industry, namely in the biotechnology entrepreneurship campus created in Biocant Park, ensures that novel scientific ideas and methodologies will contribute to a more competitive knowledge-based economy in the region. CNC.IBILI is totally committed to two other crucial aspects of any research institute that aims to excel, namely training and science communication. In-house masters and PhD Programs and international training networks coordinated by CNC.IBILI will ensure the high-level and multidisciplinary mentoring of PhD students, clinicians and postdoctoral fellows in an international environment that fosters creative critical thinking in both basic and applied science. The need to be socially active and provide an efficient outreach program that helps create an informed citizenship on scientific matters is another important aspect of the CNC.IBILI mission statement. CNC.IBILI is a hub for high-level expertise for basic and translational research, as well as for creating value through innovation and entrepreneurship, and for training biomedical students and clinicians according to the highest standards. Throughout the time of this proposal CNC.IBILI aims to be an international reference in its areas of intervention, and a magnet for knowledge-based regional development and economic growth. O CNC.IBILI é um novo Centro de Investigação que resulta da fusão de dois Centros de excelência, o CNC e o IBILI. Contando com a maior massa crítica de investigadores na área da Biomedicina na Região Centro, o CNC.IBILI junta investigadores da Universidade de Coimbra ligados às Faculdades de Farmácia, Medicina e Ciências e Tecnologia, bem como ao Instituto de Investigação Interdisciplinar, tendo atraído de forma competitiva financiamentos consideráveis, nacionais e internacionais. Esta estrutura multidisciplinar focada em objetivos comuns permite a criação de novas sinergias nas áreas de intervenção privilegiadas do CNC.IBILI. O Centro é composto por 21 grupos de investigação de alto nível organizados em três Linhas Temáticas que compartilham uma mesma filosofia de intervenção, envolvendo vários tipos de modelos e estratégias que ambicionam evoluir da ciência básica à ciência aplicada, da molécula ao Homem. A Linha de Neurociências, Visão e Doenças do Cérebro pretende integrar conhecimento celular e molecular com fisiologia, redes neuronais e imagiologia, de modo a decifrar o funcionamento do cérebro, com destaque para a visão, comportamento, e para a disfunção que ocorre em doenças neurodegenerativas e neuropsiquiátricas. A Linha de Metabolismo, Envelhecimento e Doença estudará as bases celulares de disfunção metabólica (com destaque para a função mitocondrial e stresse oxidativo) e de que modo influenciam a evolução da diabetes, doenças neurodegenerativas, e efeitos associados ao envelhecimento, sugerindo novas estratégias terapêuticas e possibilidades de diagnóstico precoce não invasivo. A Linha de Estratégias Terapêuticas Avançadas utilizará diferentes tipos de plataformas inovadoras baseadas em técnicas moleculares, vectores virais e não virais e Células Estaminais de modo a propôr novas terapias para cancro e doenças neurodegenerativas, infecciosas e cardiovasculares. De modo a desenvolver estas linhas temáticas, o CNC.IBILI tem acesso a equipamentos de ponta ao nível de imagiologia (com destaque para as valências do Instituto de Ciências Nucleares Aplicadas à Saúde - ICNAS), electrofisiologia, comportamento e análise genómica, proteómica e metabolómica em larga escala. Para desenvolver o plano estratégico proposto, o Centro conta não só com os cientistas que compõem a presente proposta, mas com a atração de novos investigadores de excelência através de concursos competitivos nacionais (Investigador FCT) e Internacionais (iniciativas ERC, EMBO e Marie Curie). Por outro lado, a junção de massa crítica num novo Centro permitirá expandir a já significativa participação em grandes redes e consórcios internacionais, potenciando a capacidade científica e de financiamento externo. No âmbito do plano estratégico cabem ainda duas missões fundamentais para qualquer Centro de Investigação de Excelência: a formação avançada e a ligação com a comunidade. O CNC.IBILI tem uma forte tradição na formação pós-graduada ao nível de Mestrado e Doutoramento com qualidade internacional, bem como no desenvolvimento da carreira de jovens investigadores pós-doutorados. Para além de participação em vários Programas da Universidade de Coimbra, o CNC.IBILI desenvolve o seu próprio Programa Doutoral, participa em várias redes de formação europeias, e pretende liderar novas iniciativas nas áreas correspondentes às três linhas temáticas propostas, fomentando a multidisciplinaridade, a criatividade e o pensamento crítico. Por outro lado Investigadores do CNC.IBILI estarão fortemente integrados na comunidade, quer ao nível de ações de divulgação científica desenvolvidas em diferentes ambientes públicos, escolas ou associações, quer em laboratórios abertos à sociedade, quer na produção de conteúdos destinados a diferentes públicos. O objectivo do CNC.IBILI é promover uma cidadania ativa e informada do ponto de vista científico, abrindo as portas a novas oportunidades junto de associações de doentes, empresas ou mecenas. Para além de um forte investimento na investigação básica, a estreita ligação ao Centro Hospitalar Universitário de Coimbra (CHUC) e ao Biocant Park concede ao CNC.IBILI valências únicas no âmbito da investigação clínica translacional, e de transferência de conhecimento e bioempreendedorismo. A experiência clínica existente nos CHUC, bem como o acesso a doentes permitirá aos investigadores do CNC.IBILI evoluir no sentido de transformar descobertas científicas em novas técnicas de diagnóstico e terapêuticas. A participação da AIBILI, uma associação dedicada a ensaios clínicos, permitirá ao novo Centro dar o passo fundamental da investigação de bancada para as aplicações clínicas. Em paralelo, será feito um grande esforço no sentido de transformar inovações científicas em propriedade intelectual que possa potenciar a transferência de tecnologia e a criação de valor económico acrescentado. Para realizar esse objectivo, o CNC.IBILI conta com a experiência do Biocant Park e das empresas biotecnológicas nele instaladas, bem como a relação direta com empresas com intervenção na área da Biomedicina (Siemens, Janssen, Bial). A formação avançada em ambiente industrial será também fomentada de modo a dar a jovens cientistas a oportunidade de criar novas empresas e assegurar a sua própria empregabilidade futura. O CNC.IBILI situa-se no centro de uma rede organizada de valências de alto nível, que vão da investigação básica à investigação clínica translacional e à criação de valor acrescentado, com uma forte componente de formação avançada. Ambiciona pois ser um polo de desenvolvimento regional, e sobretudo um Centro de Investigação de referência internacional nas suas áreas de intervenção.