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  • Authors: Mandri, Btissam; Oufdou, Khalid; Faghire, Mustapha; Drevon, Jean-Jacques; +1 Authors

    Contexte: La déficience en phosphore (P) est l'une des nombreuses contraintes environnementales qui limitent la production des légumineuses dans la région du Haouz. Ceci exige de chercher des souches de rhizobia quipourraient, par l’association symbiotique, conférer aux plantes de haricot (Phaseolus vulgaris) une tolérance relative au déficit en P et améliorer sa production sous cette contrainte. L’objectif de ce travail c’est l’étude de l’effet de la déficience phosphatée sur les paramètres de croissance et de nodulation chez ces combinaisons symbiotiques ainsi que l’évaluation des activités phosphatases et phytases au niveau des nodules, des racines et des feuilles des plantes de haricot inoculées par des souches de rhizobia et cultivées sous nutrition phosphatée limitante. [br/]Méthodes: Dans cette optique, nous avons étudié la variation d’utilisation du phosphore chez le haricot sous des conditions semicontrôlées. Ainsi, l’étude comparative des interactions symbiotiques a été effectuée entre les génotypes de P. vulgaris: Flamingo, Paulista, 115, 147 et les souches de rhizobia : la souche locale de rhizobium gallicum et la souche de rhizobia CIAT899.[br/]Résultats: Les résultats ont montré que l’inoculation par la souche locale R. gallicum a permis une amélioration relative, par rapport à l’inoculation par la souche CIAT899, des paramètres de croissance et de nodulation chezplusieurs combinaisons testées sous déficit en P. Nous avons également mis en évidence une augmentation des activités phosphatases acides et phytases sous déficit en P, qui a été plus marquée chez les plantes inoculées par R. gallicum sous déficit en P.[br/]Conclusion: Les réactions adaptatives des symbioses rhizobia-haricot dans ces conditions de déficience en P pourraient améliorer la performance de P. vulgaris sous cette contrainte environnementale.

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    Authors: Le Bescot, Noan;

    Les dinoflagellés forment un groupe complexe de protistes avec une grande diversité de morphologies, physiologies, et cycles de vies qui leur confèrent une forte capacité d'adaptation à l'ensemble des milieux (marins et dulçaquicoles) et habitats (pélagiques et benthiques) aquatiques rendant difficile l¿étude de leur diversité et de leur écologie. L'objectif de cette thèse a été la recherche de patrons globaux de biodiversité et de structuration des communautés de dinoflagellés pélagiques marins à l'échelle planétaire. Un protocole d'échantillonnage morphogénétique, couvrant la totalité de leur spectre de taille et une partie importante de leurs variabilités spatio-temporelles, a été développé (Tara-Oceans). Divers outils d'acquisition automatique à haut débit des données ont été testés. La diversité, l'abondance relative et la distribution géographique des espèces du genre Neoceratium ont été évaluées en mer Méditerranée par FlowCAM. Une étude de la structuration de la biodiversité a été réalisée par metabarcoding de l¿ADNr 18S (fragment V9). La construction d'une base de séquences ADNr de référence (DinR2) a permis l¿assignation taxonomique des metabarcodes environnementaux. L¿approche par metabarcode révèle une diversité remarquable et insoupçonnée des pico-dinoflagellés (<5µm) et que, indépendamment de l'écosystème étudié et de la période d'échantillonnage, l¿abondance des différents ordres dépend essentiellement de la taille (pico-, nano-, micro-, et meso-plancton). La structuration des communautés de dinoflagellés de différentes fractions de tailles de la zone photique a été confrontée à certains facteurs environnementaux ouvrant des pistes de recherche prometteuses Dinoflagellates form a complex group of protists with a variety of morphologies, physiologies, and life cycles that give them a strong adaptation to all aquatic environments (marine and freshwater) and habitats (pelagic and benthic) making difficult to study their diversity and ecology. The objective of this thesis was the search for global biodiversity patterns and community structure of marine pelagic dinoflagellates across the world?s oceans. A morphogenetic sampling protocol, covering the entire spectrum of their size and an important part of their spatio-temporal variability, was developed (Tara-Oceans). Various tools for an automatic acquisition broadband data were tested. Diversity, relative abundance and geographical distribution of the genus Neoceratium were evaluated by FlowCAM in Mediterranean Sea. A study of the structure of biodiversity was conducted by metabarcoding with 18S rDNA (V9 fragment). Building a base of rDNA reference sequences (DinR2) allowed the taxonomic assignment of environmental metabarcodes. The metabarcode approach reveals a remarkable and unexpected diversity of pico-dinoflagellates (<5?m) and, regardless of the studied ecosystem and the sampling period, that abundance of different levels mainly depends to the size fractions (pico-, nano-, micro- and meso- plankton). Structuring of dinoflagellates communities in different size fractions of the photic zone was facing to some environmental factors and opens promising avenues for research

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    Contexte: La déficience en phosphore (P) est l'une des nombreuses contraintes environnementales qui limitent la production des légumineuses dans la région du Haouz. Ceci exige de chercher des souches de rhizobia quipourraient, par l’association symbiotique, conférer aux plantes de haricot (Phaseolus vulgaris) une tolérance relative au déficit en P et améliorer sa production sous cette contrainte. L’objectif de ce travail c’est l’étude de l’effet de la déficience phosphatée sur les paramètres de croissance et de nodulation chez ces combinaisons symbiotiques ainsi que l’évaluation des activités phosphatases et phytases au niveau des nodules, des racines et des feuilles des plantes de haricot inoculées par des souches de rhizobia et cultivées sous nutrition phosphatée limitante. [br/]Méthodes: Dans cette optique, nous avons étudié la variation d’utilisation du phosphore chez le haricot sous des conditions semicontrôlées. Ainsi, l’étude comparative des interactions symbiotiques a été effectuée entre les génotypes de P. vulgaris: Flamingo, Paulista, 115, 147 et les souches de rhizobia : la souche locale de rhizobium gallicum et la souche de rhizobia CIAT899.[br/]Résultats: Les résultats ont montré que l’inoculation par la souche locale R. gallicum a permis une amélioration relative, par rapport à l’inoculation par la souche CIAT899, des paramètres de croissance et de nodulation chezplusieurs combinaisons testées sous déficit en P. Nous avons également mis en évidence une augmentation des activités phosphatases acides et phytases sous déficit en P, qui a été plus marquée chez les plantes inoculées par R. gallicum sous déficit en P.[br/]Conclusion: Les réactions adaptatives des symbioses rhizobia-haricot dans ces conditions de déficience en P pourraient améliorer la performance de P. vulgaris sous cette contrainte environnementale.

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    Les dinoflagellés forment un groupe complexe de protistes avec une grande diversité de morphologies, physiologies, et cycles de vies qui leur confèrent une forte capacité d'adaptation à l'ensemble des milieux (marins et dulçaquicoles) et habitats (pélagiques et benthiques) aquatiques rendant difficile l¿étude de leur diversité et de leur écologie. L'objectif de cette thèse a été la recherche de patrons globaux de biodiversité et de structuration des communautés de dinoflagellés pélagiques marins à l'échelle planétaire. Un protocole d'échantillonnage morphogénétique, couvrant la totalité de leur spectre de taille et une partie importante de leurs variabilités spatio-temporelles, a été développé (Tara-Oceans). Divers outils d'acquisition automatique à haut débit des données ont été testés. La diversité, l'abondance relative et la distribution géographique des espèces du genre Neoceratium ont été évaluées en mer Méditerranée par FlowCAM. Une étude de la structuration de la biodiversité a été réalisée par metabarcoding de l¿ADNr 18S (fragment V9). La construction d'une base de séquences ADNr de référence (DinR2) a permis l¿assignation taxonomique des metabarcodes environnementaux. L¿approche par metabarcode révèle une diversité remarquable et insoupçonnée des pico-dinoflagellés (<5µm) et que, indépendamment de l'écosystème étudié et de la période d'échantillonnage, l¿abondance des différents ordres dépend essentiellement de la taille (pico-, nano-, micro-, et meso-plancton). La structuration des communautés de dinoflagellés de différentes fractions de tailles de la zone photique a été confrontée à certains facteurs environnementaux ouvrant des pistes de recherche prometteuses Dinoflagellates form a complex group of protists with a variety of morphologies, physiologies, and life cycles that give them a strong adaptation to all aquatic environments (marine and freshwater) and habitats (pelagic and benthic) making difficult to study their diversity and ecology. The objective of this thesis was the search for global biodiversity patterns and community structure of marine pelagic dinoflagellates across the world?s oceans. A morphogenetic sampling protocol, covering the entire spectrum of their size and an important part of their spatio-temporal variability, was developed (Tara-Oceans). Various tools for an automatic acquisition broadband data were tested. Diversity, relative abundance and geographical distribution of the genus Neoceratium were evaluated by FlowCAM in Mediterranean Sea. A study of the structure of biodiversity was conducted by metabarcoding with 18S rDNA (V9 fragment). Building a base of rDNA reference sequences (DinR2) allowed the taxonomic assignment of environmental metabarcodes. The metabarcode approach reveals a remarkable and unexpected diversity of pico-dinoflagellates (<5?m) and, regardless of the studied ecosystem and the sampling period, that abundance of different levels mainly depends to the size fractions (pico-, nano-, micro- and meso- plankton). Structuring of dinoflagellates communities in different size fractions of the photic zone was facing to some environmental factors and opens promising avenues for research

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