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10
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Date (most recent)
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  • French
    Authors: 
    Nicolas Artero, Chloé;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    International audience

  • French
    Authors: 
    Feler, Anne;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    International audience

  • French
    Authors: 
    Nerzic, Pierre; Smits, Grégory; Pivert, Olivier; Lesot, Marie-Jeanne;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    National audience; This paper describes FuzViz, a tool to explore interactively massive relational data. FuzViz relies on a method building automatically linguistic summaries, that provide concise and intelligible insights in the data content. It offers an interactive view of these summaries, dynamically recomputed on demand. To ensure a fluid exploration of the data, FuzViz exploits the proposition of a highly efficient method for estimating the cardinality ofthe summary properties, estimated from statistics about the data distribution stored in the relational data base, consolidated by a sampling-based approach. The proposed workflow also involves a vocabulary inference mechanism from these statistics.; Cet article présente un outil d'exploration interactive de données massives stockées dans un système de gestion de base de données (SGBD), nommé FuzViz. Il repose sur une méthode de construction automatique de résumés linguistiques, qui fournissent une synthèse concise et intelligible du contenu des données. Il offre une vue interactive de ces résumés recalculée dynamiquement selon les demandes de l'utilisateur. Pour assurer une exploration fluide des propriétés décrites par ces résumés, FuzViz s'appuie sur la proposition d'une méthode efficace d'estimations de leurs cardinalités, produites à partir des statistiques sur la distribution des données gérées par le SGBD et consolidées par une approche basée sur un échantillonnage. L'outil propose de plus un mécanisme d'inférence de vocabulaire flou à partir de ces statistiques.

  • French
    Authors: 
    Smits, Grégory; Lesot, Marie-Jeanne; Yepmo, Véronne; Pivert, Olivier;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    International audience; The paper addresses the tasks of anomaly detection and explanation simultaneously, in the human-in-the-loop paradigm integrating the end-user expertise : it first proposes to exploit two complementary data representations to identify anomalies, namely the description induced by the raw features and the description induced by a userdefined vocabulary. These representations respectively lead to identify so-called data-driven and knowledge driven anomalies. The paper then proposes to confront these two sets of instances so as to improve the detection step and to dispose of tools towards anomaly explanations. It distinguishes and discusses three cases, underlining how the two description spaces can benefit from oneanother, in terms of accuracy and interpretability.; La personnalisation par prise en compte de l'expertise de l'utilisateur des processus de détection d'anomalies est le sujet principal de cet article. Les anomalies sont identifiées dans deux espaces de représentation des données, l'espace initial composé des valeurs brutes et l'espace induit par un vocabulaire flou défini par l'utilisateur sur ces attributs initiaux. L'application de toute méthode de détection d'anomalies sur ces deux espaces conduit à différencier des anomalies issues des données brutes de celles issues du vocabulaire. Afin à la fois d'améliorer la détection des exceptions et de disposer d'outils pour les expliquer, ces deux ensembles d'anomalies sont confrontés. Trois situations émanant de cette comparaison sont étudiées afin de montrer comment l'utilisation combinée des deux espaces améliore l'efficacité de la procédure de détection d'anomalies ainsi que l'interprétabilité des résultats qu'elle génère.

  • French
    Authors: 
    Vanheems, Régine;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    International audience

  • French
    Authors: 
    Feler, Anne;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    International audience

  • French
    Authors: 
    Abdou Arbi, Oumarou; Siegel, Anne; Bourdon, Jérémie;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    International audience; Metabolic networks are composed by all the biochemical reactions that can take place within an organism, as well as the exchanges of metabolites between the organism and its environment. The metabolic network of many organisms has been reconstructed, either manually or automatically, including at the scale of the entire genome. These models are stored in biological reference databases. Diets can be applied to these networks to model the behavior of organisms, when subjected to a specific diet. In this work, we automate an approach that allows, for each input nutrient in the network, to determine the percentages that are distributed in the different outputs when the organism is forced to evolve in a given diet. We name this approach nAIO (normalized Allocation of inputs on outputs. The nAIO is computed thanks to the inversion of a large-scale matrix and is combined with linear optimization problems. We apply this calculation to all known bacterial networks from studies of the gut microbiota and stored in the Virtual Metabolic Human database. The calculation of nAIOs shows that computation times do not depend on the size of the network but rather on the selected diet. The nAIO calculation also shows that for some bacteria the nAIOsare independent of diet. For these bacteria the nAIOs can be used to make predictions that resultin a linear relationship between the inputs of the system and its outputs.

  • French
    Authors: 
    Vanessa Fokou; Peggy Cellier; Maurice Tchuente; Alexandre Termier;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    International audience; Repetitive tasks are most often tedious; in order to facilitate their execution, program synthesis approaches have been developed. They consist in automatically inferring programs that satisfy the intention of a user. The best known approach in program synthesis is FlashFill integrated into the Excel spreadsheet which allows the processing of character strings. In FlashFill user intent is represented by examples i.e, pairs (input, output). FlashFill explores a very large space of programs and therefore can require a lot of execution time and infer a lot of programs some of which work on given examples but do not capture the user's intent. In this article, we propose two approaches QuickMixte and QuickFill based on blocks which aim to guide the exploration of the program space of FlashFill by enriching the specifications provided by the user. These approaches ask the user to provide associations between subparts of the output and the input to refine the specifications. Experiments carried out on a series of 12 datasets show that QuickMixte and QuickFill make it possible to considerably reduce the program space of FlashFill. We show that with these approaches, it is often possible to give fewer examples than with the original FlashFill algorithm for a larger proportion of correct programs.Keywords : Synthesis of programs, programming by example, manipulation of character strings, repetitive tasks, block approach.; Les tâches répétitives sont le plus souvent fastidieuses ; afin de faciliter leur exécution, les approches de synthèse de programmes ont été développées. Elles consistent à inférer automatiquement des programmes qui satisfont l'intention d'un utilisateur. L'approche la plus connue en synthèse de programmes est FlashFill intégrée au tableur Excel qui permet le traitement des chaînes de caractères. Dans FlashFill l'intention de l'utilisateur est représentée par des exemples i.e, des couples (entrée, sortie). FlashFill explore un très grand espace de programmes et peut donc nécessiter un temps d'exécution important et inférer beaucoup de programmes dont certains fonctionnent sur des exemples donnés mais ne capturent pas l'intention de l'utilisateur. Dans cet article, nous proposons deux approches QuickMixte et QuickFill basées sur les blocs qui visent à guider l'exploration de l'espace de programmes de FlashFill en enrichissant les spécifications fournies par l'utilisateur. Ces approches demandent à l'utilisateur de fournir des associations entre les sous-parties de la sortie et de l'entrée pour affiner les spécifications. Les expérimentations menées sur une série de 12 jeux de données montrent que QuickMixte et QuickFill permettent de réduire considérablement l'espace de programmes de FlashFill. Nous montrons qu'avec ces approches, il est souvent possible de donner moins d'exemples qu'avec l'algorithme FlashFill original pour une plus grande proportion de programmes corrects.

  • Publication . Article . Conference object . 2022
    French
    Authors: 
    Nekka, Hadj;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France
  • Publication . Conference object . 2022
    French
    Authors: 
    Picard, Clément; Le Capitaine, Hoel;
    Publisher: HAL CCSD
    Country: France

    International audience

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