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    Authors: Chênais, Nathalie; Nóbrega, Rafael; Thomas, Manon; Porcon, Béatrice; +6 Authors

    National audience; Les mécanismes impliqués dans le renouvèlement des cellules germinales souches chez les mâles immatures ou chez les individus adultes sexuellement matures restent très mal connus, en particulier chez les poissons. La production d'organoïdes testiculaires est une approche de choix pour étudier les interactions moléculaires entre les cellules somatiques et les cellules germinales ainsi que les modes de divisions symétriques et/ou asymétriques des cellules souches germinales. En effet, au contraire des cultures 2D, les organoïdes pourraient permettre de reproduire une niche germinale plus proche de celle rencontrée in vivo.

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    Authors: Dupé, Sandrine; Cardinal, Jérôme; Levain, Alix;

    Cet article analyse les effets de la littoralité sur l’évolution de l’inscription socio-spatiale de l’activité agricole, quand elle est exacerbée par le contexte insulaire, comme sur l’île de Bréhat. En croisant analyse spatiale et données ethnographiques, nous y repérons et décrivons, depuis le xxe siècle, des moments de déstabilisations successives construits à plusieurs échelles, qui redessinent la place et les fonctions de l’agriculture au cours du temps. Trois agencements socio-spatiaux temporairement stables, que nous qualifierons de « pactes territoriaux », émergent. Les évolutions de l’inscription de l’agriculture dans l’espace social local sont corrélées à une transformation de la ruralité sur le territoire. Le premier pacte territorial s’étend du début du xxe siècle jusqu’aux années 1960. L’agriculture est vivrière et constitue un socle dans l’organisation sociale de l’île, bien que l’arrivée de touristes diversifie les ressources économiques locales. Au tournant des années 1960, l’ampleur du tourisme et la difficulté à s’inscrire dans les nouvelles politiques agricoles nationales déstabilisent cet équilibre. L’agriculture se marginalise et perd sa fonction localement structurante : la fin des paysans coïncide avec la fin de la ruralité. Enfin, l’activité agricole se redynamise au cours de la dernière décennie, en même temps qu’elle est mise en débat publiquement, re-créant un espace de proximité entre divers usagers du territoire. C’est une forme de ruralité ré-inventée qui est consacrée, ouvrant une position circonscrite aux acteurs agricoles. Pour prétendre obtenir du foncier disponible, ils doivent s’insérer dans un modèle d’agriculture multifonctionnelle, faisant de l’île un jardin aux fonctions productives et esthétiques. Les rapports de force et la distribution du pouvoir préexistant évoluent peu, et l’agriculture locale reste marquée par des formes de précarité économique et foncière. This article analyzes the effects of the coastline on the evolution of the socio-spatial insertion of agricultural activity, when it is exacerbated by the insular context, as on the island of Brehat. By combining spatial analysis and ethnographic data, we describe the forms and effects of the successive destabilizations built on several scales that Brehat has known since the 20th century. We analyze how they redesign the place and functions of agriculture over time. Three temporarily stable socio-spatial arrangements, which we qualify as “territorial pacts” emerge. Changes in the inclusion of agriculture in the local social space are correlated with a transformation of rurality in the territory. The first territorial pact extends from the beginning of the 20th century until the 1960s. Subsistence farming constitutes a base in the social organization of the island, although the arrival of tourists diversifies the local economic resources. At the turn of the 1960s, the extent of tourism and the difficulty of fitting into new national agricultural policies destabilizes this balance. Farming is marginalized and loses its structuring function locally: the vanishing of peasants coincides with the end of rurality. Finally, farming activity has gained momentum over the past decade, at the same time as it is the subject of public debate, recreating a space of proximity between various stakeholders. It is a form of re-invented rurality that is consecrated, opening up a circumscribed position to agricultural actors. To claim to obtain available land, they must fit in a multifunctional agricultural model, making the island a garden with productive and aesthetic functions. The pre-existing balance of power changes little, and local farming remains characterized by forms of economic and land insecurity.

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    Authors: Radakovitch, Olivier; Delaval, Adrien; Boyer, Patrick; Duffa, Céline; +2 Authors

    Ce livrable présente les travaux réalisés sur le mécanisme de désorption des radionucléides à l’embouchure du Rhône et les campagnes de terrain estivales destinées à évaluer l’étendue du coin salé. Certains éléments traces métalliques fixés sur des particules fluviales peuvent passer en phase dissoute lorsqu’ils arrivent en mer sous l’effet d’une désorption. Leur devenir en Méditerranée devient alors différent, et ceci peut avoir des conséquences en termes d’évaluation du risque et pour le cas de rejets accidentels dans le fleuve. L’étude s’est focalisée sur le comportement du Césium-137 dans cette zone, un élément radioactif associé aux installations nucléaires. Les objectifs étaient d’évaluer si cet élément est effectivement désorbé à son arrivée en milieu salé, l’interface eau douce-eau salé pouvant se produire en mer ou à l’intérieur des terres. Ce dernier cas étant un des plus impactant, la structuration du coin salé lorsqu’il pénètre dans le Rhône a été étudiée pour définir ses caractéristiques. Le 137Cs peut se désorber à partir d’une salinité de 3 à 4 g/l. Les activités actuelles dans le Rhône sont très faibles et ne permettent pas de mettre en évidence ce phénomène in-situ, mais les développements méthodologiques réalisés permettront désormais de faire ces mesures à tout moment en cas de besoin (rejets accidentels). La stratification du coin salé dans le fleuve se met en place dès que les débits tombent en dessous de 1500-1200 m3/s. Les techniques de mesure (ADCP, CTD) permettent d’avoir une très bonne représentation de ces structures dans l’espace, qui montrent une stratification extrêmement marquée. La remontée dans les terres est fortement corrélée au débit moyen sur les 5 jours précédents. Ces données sont et seront utilisées pour réaliser la modélisation hydrologique de cette interface dans l’OSR 6.

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  • Authors: Barré , Éric;

    n°90

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    Authors: LE COZ, Jerome; Camenen, B.; Faure, Jean-Baptiste; LAUNAY, Marina; +5 Authors

    L’axe D de l’OSR5 regroupe les outils numériques et de communication : modèle hydro-sédimentaire, base de données BDOH pour les calculs de flux, web-SIG et métadonnées. Ce document décrit les améliorations et applications opérationnelles effectuées sur le modèle hydro-sédimentaire 1D du Rhône développé dans le cadre de l’Observatoire des Sédiments du Rhône pour les années 2018 à 2020 (OSR5). Le développement du modèle hydro-sédimentaire 1D est une action transversale à l’OSR5 qui vient alimenter les problématiques des actions A2, B2, B3, C1, C2 et C3 en lien avec l’évolution des fonds et les impacts sur les lignes d’eau, la charge de fond, les flux de MES, de contaminants et de sable. Les travaux effectués se sont concentrés sur la modélisation des flux de MES de l’échelle de l’évènement au pluriannuel et le développement des outils de modélisation (Mage 8, couplage Mage-Adis-TS, charriage et évolution des fonds). Une démarche de comparaison et d’intégration des outils de simulation numériques INRAE, IRSN et Ifremer a progressé en vue d’actions communes.

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  • Authors: Gasperi, Johnny; Tramoy, Romain; Dris, Rachid; Blot, Denis; +1 Authors

    Journées scientifiques de l'Université de Nantes, NANTES, FRANCE, 01-/06/2021 - 01/06/2021; Les rivières sont censées être les principales voies de transfert des plastiques des terres vers l'océan (Lebreton et al., 2017 ; Schmidt et al., 2017). Cependant, il existe encore un manque important de connaissances sur la façon dont les déchets fluviaux, y compris les macroplastiques, sont transférés vers l'Océan. Les mesures quantitatives des émissions de macroplastiques dans les rivières suggèrent même qu'une fraction de l'ordre de 0,001 à 3% des déchets plastiques mal gérés (MPW) générés dans un bassin fluvial atteignent finalement la mer (Emmerik et al., 2019 ; Schöneich-Argent et al., 2020 ; Tramoy et al. 2021). Au lieu de cela, les macroplastiques peuvent rester dans le bassin versant et sur les côtes en raison de la dynamique complexe du transport qui retarde le transfert des déchets mal gérés des terres vers l'océan (Olivelli et al., 2020 ; Weideman et al., 2020). Afin de mieux comprendre ces dynamiques, le laboratoire Eau et Environnement et le Laboratoire Eau Environnement et Systèmes Urbains étudient la dynamique des déchets en Seine et en Loire. Pour les macrodéchets plastiques, l'ensemble des travaux engagés sur la Seine permettent de dresser une première esquisse des flux de déchets plastiques transitant en Seine, captés par les dispositifs urbains et/ou collectés par des opérations de nettoyage. Selon nos estimations, entre 100 et 200 tonnes de déchets plastiques transiteraient chaque année en Seine. A l'échelle de l'agglomération parisienne, et bien que ces valeurs s'accompagnent de fortes incertitudes, les eaux pluviales n'apporteraient qu'une part mineure de ces flux, i.e., entre 8 et 33 tonnes par an. L'étude de la dynamique des débris plastiques montre que le transfert des plastiques est loin d'être linéaire et qu'il est soumis à de nombreux phénomènes physiques à de nombreuses échelles temporelles, i.e. d'échelles courtes allant de quelques heures à quelques jours (marées hautes / basses) à des échelles beaucoup plus longues allant de plusieurs semaines (marées de printemps / creuses et marées les plus hautes) à quelques années (crues). La conséquence de ces interactions est que le transfert des débris est chaotique et qu'une part importante de ces flux peut venir s'échouer sur les berges.

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    Authors: Assolen, Alexandra;

    Introduction : les tumeurs adipeuses sont les plus fréquentes des tumeurs des tissus mous chez l’adulte. Elles comportent des tumeurs bénignes : les lipomes et des tumeurs malignes : les liposarcomes. Le terme de tumeur adipeuse atypique (ALT) est utilisé pour les liposarcomes bien différenciés (de bas grade) des membres. Le diagnostic préopératoire repose sur une micro biopsie percutanée radioguidée qui constitue le gold standard à ce jour avec étude histologique et recherche d’amplification du gène MDM2 qui caractérise les tumeurs adipeuses atypiques, représentant l’objectif de notre étude. Matériels et méthodes : nous avons réalisé une étude rétrospective dans le service d’Anatomie pathologique du CHU de la Timone portant sur 107 prélèvements micro-biopsiques scanno-guidées de tumeurs adipeuses bien différenciées de l’adulte localisées aux membres réalisées entre 2010 et 2018. Dans tous les cas la recherche d’amplification du gène MDM2 par Fluorescent In Situ Hybridization (FISH) a été réalisée. Le diagnostic final a été porté sur la pièce d’exérèse. Pour la totalité des cas de liposarcomes ainsi que pour 22 lipomes la recherche d’amplification du gène MDM2 a été réalisée sur la biopsie et sur la pièce d’exérèse par deux techniques différentes : FISH et digital droplet PCR (ddPCR). Résultats : 24 diagnostics de tumeurs adipeuses atypiques ont été faits en préopératoire. 1 cas de liposarcome myxoïde avec territoires bien différenciés adipeux majoritaires et 4 autres ALT ont été diagnostiquées sur pièce opératoire uniquement en raison des aspects histologiques et grâce à la répétition des examens moléculaires. La sensibilité de la FISH sur micro biopsie est de 86%. Celle de la ddPCR de 56% sur micro biopsie et de 86% pour les pièces opératoires. L’hétérogénéité tumorale et le faible niveau d’amplification du gène MDM2 dans les ALT sont en grande partie responsables des discordances observées entre le diagnostic préopératoire et définitif. Conclusion : Nous avons conclu à une bonne performance de la micro biopsie scanno-guidée pour le diagnostic préopératoire des tumeurs adipeuses atypiques lorsque l’analyse moléculaire est couplée à l’histologie. La FISH apparaît plus sensible que la ddPCR pour la détection de l’amplification du gène MDM2 sur micro biopsie. Cependant la ddPCR est capable de mettre en évidence l’amplification même en présence d’une polysomie. Il est important de remettre en question le diagnostic réalisé sur micro biopsie si des arguments cliniques ou histologiques « atypiques » sont mis en évidence sur la pièce d’exérèse. Dans ces cas il ne faut pas hésiter à renouveler les techniques moléculaires. Enfin, il ne faut pas méconnaitre un éventuel liposarcome myxoïde « avec territoires adipeux bien différenciés extensifs » grâce à la confrontation anatomo-clinique.

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    HAL AMU; Hal-Diderot
    Other literature type . Master thesis . 2021
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      HAL AMU; Hal-Diderot
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    Authors: Tareau, Marc-Alexandre; Dejouhanet, Lucie; Palisse, Marianne; Odonne, Guillaume;

    Les pharmacopées sont, à l’image de toute production culturelle, des objets éminemment vivants et dynamiques qui se transforment et se réinventent constamment, au fil des contacts et échanges incessants qui se jouent entre les différents groupes humains. Les plantes médicinales sont, elles aussi, des « objets bioculturels » (Pordié, 2002) par la richesse et la complexité des relations que les sociétés entretiennent avec elles, elles aussi toujours en évolution. En Guyane, et en particulier sur les espaces transfrontaliers, les interactions culturelles sont constantes. Les plantes et leurs usages circulent entre les communautés, participant au renouvellement et à l’hybridation continuelle des phytothérapies. Ces flux matériels et immatériels composent la réalité culturelle des espaces transfrontaliers du plateau des Guyanes. Cet article se focalise sur la frontière franco-brésilienne matérialisée par le fleuve Oyapock. À la lumière d’entretiens menés dans la ville de Saint-Georges-de-l’Oyapock, nous proposons une description exploratoire des flux ethnobotaniques en contexte transfrontalier, en nous intéressant aux plantes médicinales échangées, à la diffusion des savoirs associés et donc aux modes de circulation des plantes et des connaissances. Cette étude compose une partie d’une recherche plus large sur les circulations bioculturelles à l’échelle de la Guyane et de ses voisins. Pharmacopoeias are, like any kind of cultural production, living and dynamic objects that constantly change and reinvent themselves, throughout continuous contacts and exchanges between different social groups. Medicinal plants are "biocultural objects" (Pordie, 2002) as well, because of the richness and the complexity of relationships that societies develop with them. In French Guiana, especially in its cross-border areas, cultural interactions are usual. Plants and knowledge about their uses circulate among communities, contributing to a permanent renewal and a continuous hybridation of herbal medicines. These material and immaterial flows form the cultural reality of cross-border areas on the Guiana Shield. This paper focuses on the border between French Guiana and Brazil, which was made tangible by the Oyapock River. Based on interviews conducted in the French border town of Saint-Georges-de-l'Oyapock, it proposes an exploratory description of ethnobotanical flows in this cross-border context. It lists the medicinal plants used in Saint-Georges, analyses the diffusion of associated knowledge between the different communities and highlights the circulations of plants and of related medicinal knowledge in this transfrontier area. This research is one part of a larger study on biocultural circulations at the scale of French Guiana and its neighbours. As farmacopeias são, como toda produção cultural, objetos eminentemente vivos e dinâmicos que se transformam e se reinventam constantemente, ao longo dos contatos e intercâmbios incessantes que acontecem entre os diferentes grupos humanos. As plantas medicinais também são “objetos bioculturais” (Pordié, 2002) pela riqueza e complexidade das relações que as sociedades mantêm entre si, que estão igualmente sempre em evolução. Na Guiana Francesa e, especialmente, nos espaços transfonteiriços, as interações culturais são constantes. As plantas e seus usos circulam entre as comunidades, participando assim da renovação e hibridação contínuas das fitoterapias. Esses fluxos materiais e imateriais compõem a realidade cultural dos espaços transfronteiriços do Planalto das Guianas. O presente artigo foca a fronteira francobrasileira, materializada pelo Rio Oiapoque. Baseados em entrevistas feitas na cidade de Saint- Georges de l’Oyapock, propomos uma descrição exploratória dos fluxos etnobotânicos em contexto transfronteiriço, interessando-nos pelas plantas medicinais intercambiadas, pela difusão dos saberes a elas associados e, logo, pelos modos de circulação das plantas e conhecimentos. Este estudo integra uma pesquisa mais ampla sobre as circulações bioculturais na região da Guiana Francesa e seus vizinhos.

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  • Authors: Jean-Marie, Kowalski;

    International audience

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    Authors: Lesage, Manon; Bugeon, Jérôme; Thomas, Manon; Thermes, Violette;

    International audience; L'analyse quantitative du contenu cellulaire d'organes entiers par microscopie permet de comprendre leur organisation en conditions physiologiques ou pathologiques. Dans certains cas, l'analyse exhaustive est essentielle pour évaluer par exemple l'impact d'une mutation sur la mise en place d'une fonction biologique clé. Chez le médaka (Oryzias latipes), un poisson modèle classiquement utilisé pour l'étude de la reproduction, la fertilité des femelles est directement dépendante de la croissance asynchrone des follicules ovariens. Recrutés à partir de pools de cellules germinales, les ovocytes évoluent, en fonction de leur stade de développement, au sein de follicules de différentes classes de tailles (de 20um à plus de 1000um). Chaque jour, une vingtaine d'oeufs sont ainsi pondus dans des conditions de photopériode contrôlée. Pour étudier cette dynamique de croissance, notamment dans le cas d'une lignée mutante présentant une fertilité réduite (miR-202-5p Knockout), nous cherchons à dénombrer et mesurer l'ensemble des follicules contenus dans les ovaires des femelles juvéniles et adultes. A partir d'images d'ovaires en 3D de médaka obtenus en microscopie confocale à fluorescence, nous avons mis en place une séquence d'analyse qui s'appuie sur des réseaux de neurones pré-entraînés accessibles en opensource. La segmentation 3D des follicules a été réalisée avec l'algorithme Cellpose, récemment développé par Stringer.C et al [1], et ce sans nécessiter une étape d'apprentissage sur nos images. Une étape de débruitage appliquée en amont via l'outil Noise2void [2] a également permis d'augmenter la qualité de la segmentation. Grâce aux récents développements des approches de « deep-learning » appliqués aux données de microscopie, nous avons ainsi obtenu des données quantitatives tridimensionnelles jusqu'alors inaccessibles avec des méthodes classiques (Figure 1). Ces nouveaux outils, rendus de plus en plus disponibles aux non-spécialistes du domaine, ont ainsi ouvert la voie à un phénotypage cellulaire profond, dès les stades larvaires précoces chez les femelles invalidées pour le miR-202.

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    Authors: Chênais, Nathalie; Nóbrega, Rafael; Thomas, Manon; Porcon, Béatrice; +6 Authors

    National audience; Les mécanismes impliqués dans le renouvèlement des cellules germinales souches chez les mâles immatures ou chez les individus adultes sexuellement matures restent très mal connus, en particulier chez les poissons. La production d'organoïdes testiculaires est une approche de choix pour étudier les interactions moléculaires entre les cellules somatiques et les cellules germinales ainsi que les modes de divisions symétriques et/ou asymétriques des cellules souches germinales. En effet, au contraire des cultures 2D, les organoïdes pourraient permettre de reproduire une niche germinale plus proche de celle rencontrée in vivo.

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    Authors: Dupé, Sandrine; Cardinal, Jérôme; Levain, Alix;

    Cet article analyse les effets de la littoralité sur l’évolution de l’inscription socio-spatiale de l’activité agricole, quand elle est exacerbée par le contexte insulaire, comme sur l’île de Bréhat. En croisant analyse spatiale et données ethnographiques, nous y repérons et décrivons, depuis le xxe siècle, des moments de déstabilisations successives construits à plusieurs échelles, qui redessinent la place et les fonctions de l’agriculture au cours du temps. Trois agencements socio-spatiaux temporairement stables, que nous qualifierons de « pactes territoriaux », émergent. Les évolutions de l’inscription de l’agriculture dans l’espace social local sont corrélées à une transformation de la ruralité sur le territoire. Le premier pacte territorial s’étend du début du xxe siècle jusqu’aux années 1960. L’agriculture est vivrière et constitue un socle dans l’organisation sociale de l’île, bien que l’arrivée de touristes diversifie les ressources économiques locales. Au tournant des années 1960, l’ampleur du tourisme et la difficulté à s’inscrire dans les nouvelles politiques agricoles nationales déstabilisent cet équilibre. L’agriculture se marginalise et perd sa fonction localement structurante : la fin des paysans coïncide avec la fin de la ruralité. Enfin, l’activité agricole se redynamise au cours de la dernière décennie, en même temps qu’elle est mise en débat publiquement, re-créant un espace de proximité entre divers usagers du territoire. C’est une forme de ruralité ré-inventée qui est consacrée, ouvrant une position circonscrite aux acteurs agricoles. Pour prétendre obtenir du foncier disponible, ils doivent s’insérer dans un modèle d’agriculture multifonctionnelle, faisant de l’île un jardin aux fonctions productives et esthétiques. Les rapports de force et la distribution du pouvoir préexistant évoluent peu, et l’agriculture locale reste marquée par des formes de précarité économique et foncière. This article analyzes the effects of the coastline on the evolution of the socio-spatial insertion of agricultural activity, when it is exacerbated by the insular context, as on the island of Brehat. By combining spatial analysis and ethnographic data, we describe the forms and effects of the successive destabilizations built on several scales that Brehat has known since the 20th century. We analyze how they redesign the place and functions of agriculture over time. Three temporarily stable socio-spatial arrangements, which we qualify as “territorial pacts” emerge. Changes in the inclusion of agriculture in the local social space are correlated with a transformation of rurality in the territory. The first territorial pact extends from the beginning of the 20th century until the 1960s. Subsistence farming constitutes a base in the social organization of the island, although the arrival of tourists diversifies the local economic resources. At the turn of the 1960s, the extent of tourism and the difficulty of fitting into new national agricultural policies destabilizes this balance. Farming is marginalized and loses its structuring function locally: the vanishing of peasants coincides with the end of rurality. Finally, farming activity has gained momentum over the past decade, at the same time as it is the subject of public debate, recreating a space of proximity between various stakeholders. It is a form of re-invented rurality that is consecrated, opening up a circumscribed position to agricultural actors. To claim to obtain available land, they must fit in a multifunctional agricultural model, making the island a garden with productive and aesthetic functions. The pre-existing balance of power changes little, and local farming remains characterized by forms of economic and land insecurity.

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    Authors: Radakovitch, Olivier; Delaval, Adrien; Boyer, Patrick; Duffa, Céline; +2 Authors

    Ce livrable présente les travaux réalisés sur le mécanisme de désorption des radionucléides à l’embouchure du Rhône et les campagnes de terrain estivales destinées à évaluer l’étendue du coin salé. Certains éléments traces métalliques fixés sur des particules fluviales peuvent passer en phase dissoute lorsqu’ils arrivent en mer sous l’effet d’une désorption. Leur devenir en Méditerranée devient alors différent, et ceci peut avoir des conséquences en termes d’évaluation du risque et pour le cas de rejets accidentels dans le fleuve. L’étude s’est focalisée sur le comportement du Césium-137 dans cette zone, un élément radioactif associé aux installations nucléaires. Les objectifs étaient d’évaluer si cet élément est effectivement désorbé à son arrivée en milieu salé, l’interface eau douce-eau salé pouvant se produire en mer ou à l’intérieur des terres. Ce dernier cas étant un des plus impactant, la structuration du coin salé lorsqu’il pénètre dans le Rhône a été étudiée pour définir ses caractéristiques. Le 137Cs peut se désorber à partir d’une salinité de 3 à 4 g/l. Les activités actuelles dans le Rhône sont très faibles et ne permettent pas de mettre en évidence ce phénomène in-situ, mais les développements méthodologiques réalisés permettront désormais de faire ces mesures à tout moment en cas de besoin (rejets accidentels). La stratification du coin salé dans le fleuve se met en place dès que les débits tombent en dessous de 1500-1200 m3/s. Les techniques de mesure (ADCP, CTD) permettent d’avoir une très bonne représentation de ces structures dans l’espace, qui montrent une stratification extrêmement marquée. La remontée dans les terres est fortement corrélée au débit moyen sur les 5 jours précédents. Ces données sont et seront utilisées pour réaliser la modélisation hydrologique de cette interface dans l’OSR 6.

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  • Authors: Barré , Éric;

    n°90

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    Authors: LE COZ, Jerome; Camenen, B.; Faure, Jean-Baptiste; LAUNAY, Marina; +5 Authors

    L’axe D de l’OSR5 regroupe les outils numériques et de communication : modèle hydro-sédimentaire, base de données BDOH pour les calculs de flux, web-SIG et métadonnées. Ce document décrit les améliorations et applications opérationnelles effectuées sur le modèle hydro-sédimentaire 1D du Rhône développé dans le cadre de l’Observatoire des Sédiments du Rhône pour les années 2018 à 2020 (OSR5). Le développement du modèle hydro-sédimentaire 1D est une action transversale à l’OSR5 qui vient alimenter les problématiques des actions A2, B2, B3, C1, C2 et C3 en lien avec l’évolution des fonds et les impacts sur les lignes d’eau, la charge de fond, les flux de MES, de contaminants et de sable. Les travaux effectués se sont concentrés sur la modélisation des flux de MES de l’échelle de l’évènement au pluriannuel et le développement des outils de modélisation (Mage 8, couplage Mage-Adis-TS, charriage et évolution des fonds). Une démarche de comparaison et d’intégration des outils de simulation numériques INRAE, IRSN et Ifremer a progressé en vue d’actions communes.

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  • Authors: Gasperi, Johnny; Tramoy, Romain; Dris, Rachid; Blot, Denis; +1 Authors

    Journées scientifiques de l'Université de Nantes, NANTES, FRANCE, 01-/06/2021 - 01/06/2021; Les rivières sont censées être les principales voies de transfert des plastiques des terres vers l'océan (Lebreton et al., 2017 ; Schmidt et al., 2017). Cependant, il existe encore un manque important de connaissances sur la façon dont les déchets fluviaux, y compris les macroplastiques, sont transférés vers l'Océan. Les mesures quantitatives des émissions de macroplastiques dans les rivières suggèrent même qu'une fraction de l'ordre de 0,001 à 3% des déchets plastiques mal gérés (MPW) générés dans un bassin fluvial atteignent finalement la mer (Emmerik et al., 2019 ; Schöneich-Argent et al., 2020 ; Tramoy et al. 2021). Au lieu de cela, les macroplastiques peuvent rester dans le bassin versant et sur les côtes en raison de la dynamique complexe du transport qui retarde le transfert des déchets mal gérés des terres vers l'océan (Olivelli et al., 2020 ; Weideman et al., 2020). Afin de mieux comprendre ces dynamiques, le laboratoire Eau et Environnement et le Laboratoire Eau Environnement et Systèmes Urbains étudient la dynamique des déchets en Seine et en Loire. Pour les macrodéchets plastiques, l'ensemble des travaux engagés sur la Seine permettent de dresser une première esquisse des flux de déchets plastiques transitant en Seine, captés par les dispositifs urbains et/ou collectés par des opérations de nettoyage. Selon nos estimations, entre 100 et 200 tonnes de déchets plastiques transiteraient chaque année en Seine. A l'échelle de l'agglomération parisienne, et bien que ces valeurs s'accompagnent de fortes incertitudes, les eaux pluviales n'apporteraient qu'une part mineure de ces flux, i.e., entre 8 et 33 tonnes par an. L'étude de la dynamique des débris plastiques montre que le transfert des plastiques est loin d'être linéaire et qu'il est soumis à de nombreux phénomènes physiques à de nombreuses échelles temporelles, i.e. d'échelles courtes allant de quelques heures à quelques jours (marées hautes / basses) à des échelles beaucoup plus longues allant de plusieurs semaines (marées de printemps / creuses et marées les plus hautes) à quelques années (crues). La conséquence de ces interactions est que le transfert des débris est chaotique et qu'une part importante de ces flux peut venir s'échouer sur les berges.

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    Authors: Assolen, Alexandra;

    Introduction : les tumeurs adipeuses sont les plus fréquentes des tumeurs des tissus mous chez l’adulte. Elles comportent des tumeurs bénignes : les lipomes et des tumeurs malignes : les liposarcomes. Le terme de tumeur adipeuse atypique (ALT) est utilisé pour les liposarcomes bien différenciés (de bas grade) des membres. Le diagnostic préopératoire repose sur une micro biopsie percutanée radioguidée qui constitue le gold standard à ce jour avec étude histologique et recherche d’amplification du gène MDM2 qui caractérise les tumeurs adipeuses atypiques, représentant l’objectif de notre étude. Matériels et méthodes : nous avons réalisé une étude rétrospective dans le service d’Anatomie pathologique du CHU de la Timone portant sur 107 prélèvements micro-biopsiques scanno-guidées de tumeurs adipeuses bien différenciées de l’adulte localisées aux membres réalisées entre 2010 et 2018. Dans tous les cas la recherche d’amplification du gène MDM2 par Fluorescent In Situ Hybridization (FISH) a été réalisée. Le diagnostic final a été porté sur la pièce d’exérèse. Pour la totalité des cas de liposarcomes ainsi que pour 22 lipomes la recherche d’amplification du gène MDM2 a été réalisée sur la biopsie et sur la pièce d’exérèse par deux techniques différentes : FISH et digital droplet PCR (ddPCR). Résultats : 24 diagnostics de tumeurs adipeuses atypiques ont été faits en préopératoire. 1 cas de liposarcome myxoïde avec territoires bien différenciés adipeux majoritaires et 4 autres ALT ont été diagnostiquées sur pièce opératoire uniquement en raison des aspects histologiques et grâce à la répétition des examens moléculaires. La sensibilité de la FISH sur micro biopsie est de 86%. Celle de la ddPCR de 56% sur micro biopsie et de 86% pour les pièces opératoires. L’hétérogénéité tumorale et le faible niveau d’amplification du gène MDM2 dans les ALT sont en grande partie responsables des discordances observées entre le diagnostic préopératoire et définitif. Conclusion : Nous avons conclu à une bonne performance de la micro biopsie scanno-guidée pour le diagnostic préopératoire des tumeurs adipeuses atypiques lorsque l’analyse moléculaire est couplée à l’histologie. La FISH apparaît plus sensible que la ddPCR pour la détection de l’amplification du gène MDM2 sur micro biopsie. Cependant la ddPCR est capable de mettre en évidence l’amplification même en présence d’une polysomie. Il est important de remettre en question le diagnostic réalisé sur micro biopsie si des arguments cliniques ou histologiques « atypiques » sont mis en évidence sur la pièce d’exérèse. Dans ces cas il ne faut pas hésiter à renouveler les techniques moléculaires. Enfin, il ne faut pas méconnaitre un éventuel liposarcome myxoïde « avec territoires adipeux bien différenciés extensifs » grâce à la confrontation anatomo-clinique.

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    Authors: Tareau, Marc-Alexandre; Dejouhanet, Lucie; Palisse, Marianne; Odonne, Guillaume;

    Les pharmacopées sont, à l’image de toute production culturelle, des objets éminemment vivants et dynamiques qui se transforment et se réinventent constamment, au fil des contacts et échanges incessants qui se jouent entre les différents groupes humains. Les plantes médicinales sont, elles aussi, des « objets bioculturels » (Pordié, 2002) par la richesse et la complexité des relations que les sociétés entretiennent avec elles, elles aussi toujours en évolution. En Guyane, et en particulier sur les espaces transfrontaliers, les interactions culturelles sont constantes. Les plantes et leurs usages circulent entre les communautés, participant au renouvellement et à l’hybridation continuelle des phytothérapies. Ces flux matériels et immatériels composent la réalité culturelle des espaces transfrontaliers du plateau des Guyanes. Cet article se focalise sur la frontière franco-brésilienne matérialisée par le fleuve Oyapock. À la lumière d’entretiens menés dans la ville de Saint-Georges-de-l’Oyapock, nous proposons une description exploratoire des flux ethnobotaniques en contexte transfrontalier, en nous intéressant aux plantes médicinales échangées, à la diffusion des savoirs associés et donc aux modes de circulation des plantes et des connaissances. Cette étude compose une partie d’une recherche plus large sur les circulations bioculturelles à l’échelle de la Guyane et de ses voisins. Pharmacopoeias are, like any kind of cultural production, living and dynamic objects that constantly change and reinvent themselves, throughout continuous contacts and exchanges between different social groups. Medicinal plants are "biocultural objects" (Pordie, 2002) as well, because of the richness and the complexity of relationships that societies develop with them. In French Guiana, especially in its cross-border areas, cultural interactions are usual. Plants and knowledge about their uses circulate among communities, contributing to a permanent renewal and a continuous hybridation of herbal medicines. These material and immaterial flows form the cultural reality of cross-border areas on the Guiana Shield. This paper focuses on the border between French Guiana and Brazil, which was made tangible by the Oyapock River. Based on interviews conducted in the French border town of Saint-Georges-de-l'Oyapock, it proposes an exploratory description of ethnobotanical flows in this cross-border context. It lists the medicinal plants used in Saint-Georges, analyses the diffusion of associated knowledge between the different communities and highlights the circulations of plants and of related medicinal knowledge in this transfrontier area. This research is one part of a larger study on biocultural circulations at the scale of French Guiana and its neighbours. As farmacopeias são, como toda produção cultural, objetos eminentemente vivos e dinâmicos que se transformam e se reinventam constantemente, ao longo dos contatos e intercâmbios incessantes que acontecem entre os diferentes grupos humanos. As plantas medicinais também são “objetos bioculturais” (Pordié, 2002) pela riqueza e complexidade das relações que as sociedades mantêm entre si, que estão igualmente sempre em evolução. Na Guiana Francesa e, especialmente, nos espaços transfonteiriços, as interações culturais são constantes. As plantas e seus usos circulam entre as comunidades, participando assim da renovação e hibridação contínuas das fitoterapias. Esses fluxos materiais e imateriais compõem a realidade cultural dos espaços transfronteiriços do Planalto das Guianas. O presente artigo foca a fronteira francobrasileira, materializada pelo Rio Oiapoque. Baseados em entrevistas feitas na cidade de Saint- Georges de l’Oyapock, propomos uma descrição exploratória dos fluxos etnobotânicos em contexto transfronteiriço, interessando-nos pelas plantas medicinais intercambiadas, pela difusão dos saberes a elas associados e, logo, pelos modos de circulação das plantas e conhecimentos. Este estudo integra uma pesquisa mais ampla sobre as circulações bioculturais na região da Guiana Francesa e seus vizinhos.

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